基于大数据整合与文本挖掘的中药生物分子信息文献系统关键技术模型
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摘要
基于大数据整合和文本挖掘技术,建立具有多层次信息检索和知识推理发现功能的中药生物分子信息文献系统,介绍系统研发框架、数据库设计、特色与创新之处,指出系统能够为中药研究提供方便可靠的基础数据和分析支持,具有广阔应用前景。
Based on big data integration and text mining technology, the Traditional Chinese Medicine(TCM) biomolecular information literature system with multilevel functions of information retrieval and knowledge reasoning discovery has been built. The paper introduces system development framework, design of database, features and innovative parts, points out that the system is able to provide TCM study with convenient and reliable basic data and analysis supports and has a broad application prospective.
Based on big data integration and text mining technology, the Traditional Chinese Medicine(TCM) biomolecular information literature system with multilevel functions of information retrieval and knowledge reasoning discovery has been built. The paper introduces system development framework, design of database, features and innovative parts, points out that the system is able to provide TCM study with convenient and reliable basic data and analysis supports and has a broad application prospective.
引文
1张建英,何建成.大数据在中医学中应用的可行性分析与展望[J].中华中医药杂志,2017, 32(1):17-20.
2何伟.大数据时代与中医药学术创新[J].中医杂志,2014, 55(23):1981-1984.
3许海玉,刘振明,付岩,等.中药整合药理学计算平台的开发与应用[J].中国中药杂志,2017, 42(18):3633-3638.
4夏于芬,梁光平.大数据背景下的中药现代化[J].亚太传统医药,2015, 11(21):1-3.
5胡双,陆涛,胡建华.文本挖掘技术在药物研究中的应用[J].医学信息学杂志,2013, 34(8):49-53.
6吕婷,姜友好.文本挖掘在生物医学领域中的应用及其系统工具[J].中华医学图书情报杂志,2010, 19(4):56-64.
7任郭珉.基于文本挖掘的药用植物数据库的建立及网络药理学分析[D].北京:北京协和医学院,2014.
8郭洪涛.文本挖掘技术在中医药文献研究中的应用[J].中医学报,2013, 28(8):1151-1152.
9 Xue R, Fang Z, Zhang M, et al. TCMID:traditional Chinese medicine integrative database for herb molecular mechanism analysis[J]. Nucleic Acids Res, 2013, 41(1):1089-1095.
10 Wang Y, Suzek T, Zhang J, et al. PubChem BioAssay:2014 update[J]. Nucleic Acids Res, 2014, 42(1):1075-1082.
11 Ye H, Ye L, Kang H, et al. HIT:linking herbal active ingredients to targets[J]. Nucleic Acids Res, 2011, 39(2):1055-1059.
12 Croft D, Mundo AF, Haw R, et cal. The Reactome Pathway Knowledgebase[J]. Nucleic Acids Res, 2014, 42(3):472-477.
13 Kanehisa M, Goto S, Sato Y, et al. Data, Information,Knowledge and Principle:back to metabolism in KEGG[J]. Nucleic Acids Res, 2014, 42(3):199-205.
14江凌,杨平利,杨梅,等.基于ADO. NET技术访问SQL Server数据库的编程实现[J].现代电子技术,2014, 37(8):95-98.
15叶安胜.基于.NET架构的WEB数据库访问技术研究与应用[D].成都:电子科技大学,2004.
16宋阳,严平,曹彤.基于ASP、SQL Server 2000实现的Web文献检索系统及其查询优化[J].计算机应用与软件,2006(10):25-28.
17张贝克,焦迪楠,马昕,等.Net平台下知识网络系统及其搜索引擎的设计与实现[J].微型机与应用,2011, 30(8):4-7.
18李畅.基于模糊查询技术的文件检索系统研究[D].天津:天津大学,2012.
19葛强.基于大型数据库的智能搜索与摘要提取技术研究[D].成都:电子科技大学,2015.
20王忠,陈寅萤,张盈颖,等.多组分多靶点中药药理作用机制研究中的问题和解决策略[J].中国实验方剂学杂志,2018, 24(5):1-6.
21严蓓华,杨铭,陈佳蕾,等.复杂网络在中医药方面的研究和应用[J].中国实验方剂学杂志,2012, 18(7):276-280.
22吕庆莉.数据挖掘与复杂网络的融合及其在中医药领域应用[J].中草药,2016, 47(8):1430-1436.
2何伟.大数据时代与中医药学术创新[J].中医杂志,2014, 55(23):1981-1984.
3许海玉,刘振明,付岩,等.中药整合药理学计算平台的开发与应用[J].中国中药杂志,2017, 42(18):3633-3638.
4夏于芬,梁光平.大数据背景下的中药现代化[J].亚太传统医药,2015, 11(21):1-3.
5胡双,陆涛,胡建华.文本挖掘技术在药物研究中的应用[J].医学信息学杂志,2013, 34(8):49-53.
6吕婷,姜友好.文本挖掘在生物医学领域中的应用及其系统工具[J].中华医学图书情报杂志,2010, 19(4):56-64.
7任郭珉.基于文本挖掘的药用植物数据库的建立及网络药理学分析[D].北京:北京协和医学院,2014.
8郭洪涛.文本挖掘技术在中医药文献研究中的应用[J].中医学报,2013, 28(8):1151-1152.
9 Xue R, Fang Z, Zhang M, et al. TCMID:traditional Chinese medicine integrative database for herb molecular mechanism analysis[J]. Nucleic Acids Res, 2013, 41(1):1089-1095.
10 Wang Y, Suzek T, Zhang J, et al. PubChem BioAssay:2014 update[J]. Nucleic Acids Res, 2014, 42(1):1075-1082.
11 Ye H, Ye L, Kang H, et al. HIT:linking herbal active ingredients to targets[J]. Nucleic Acids Res, 2011, 39(2):1055-1059.
12 Croft D, Mundo AF, Haw R, et cal. The Reactome Pathway Knowledgebase[J]. Nucleic Acids Res, 2014, 42(3):472-477.
13 Kanehisa M, Goto S, Sato Y, et al. Data, Information,Knowledge and Principle:back to metabolism in KEGG[J]. Nucleic Acids Res, 2014, 42(3):199-205.
14江凌,杨平利,杨梅,等.基于ADO. NET技术访问SQL Server数据库的编程实现[J].现代电子技术,2014, 37(8):95-98.
15叶安胜.基于.NET架构的WEB数据库访问技术研究与应用[D].成都:电子科技大学,2004.
16宋阳,严平,曹彤.基于ASP、SQL Server 2000实现的Web文献检索系统及其查询优化[J].计算机应用与软件,2006(10):25-28.
17张贝克,焦迪楠,马昕,等.Net平台下知识网络系统及其搜索引擎的设计与实现[J].微型机与应用,2011, 30(8):4-7.
18李畅.基于模糊查询技术的文件检索系统研究[D].天津:天津大学,2012.
19葛强.基于大型数据库的智能搜索与摘要提取技术研究[D].成都:电子科技大学,2015.
20王忠,陈寅萤,张盈颖,等.多组分多靶点中药药理作用机制研究中的问题和解决策略[J].中国实验方剂学杂志,2018, 24(5):1-6.
21严蓓华,杨铭,陈佳蕾,等.复杂网络在中医药方面的研究和应用[J].中国实验方剂学杂志,2012, 18(7):276-280.
22吕庆莉.数据挖掘与复杂网络的融合及其在中医药领域应用[J].中草药,2016, 47(8):1430-1436.