基于硬蜱small RNA数据库中相关microRNA表达谱分析
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- 论文作者：吴锋 ; 罗金 ; 陈泽 ; 任巧云 ; 罗建勋 ; 殷宏 ; 刘光远
- 年：2016
- 作者机构：中国农业科学院兰州兽医研究所/家畜疫病病原生物学国家重点实验室/甘肃省动物寄生虫病重点实验室;扬州大学/江苏高校动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心;
- 论文关键词：蜱 ; microRNA ; 表达谱 ; 碱基偏向
- 会议召开时间：2016-08-08
- 会议录名称：中国动物学会寄生虫学专业委员会第十届全国寄生虫学青年工作者学术研讨会论文摘要集
- 英文会议录名称：The Abstracts of the Tenth Symposium for Yong Scientists of China Society of Parasitology
- 语种：中文
- 分类号：S852.746
- 学会代码：JISC
- 会议名称：中国动物学会寄生虫学专业委员会第十届全国寄生虫学青年工作者学术研讨会
- 会议地点：中国四川成都
- 主办单位：中国动物学会寄生虫学专业青年委员会
- 学会名称：中国动物学会寄生虫学专业委员会
- 页数：1
- 文件大小：601k
- 原文格式：D
- 会议级别：全国
摘要
目的:microRNA(miRNA)是一类长度约为21~25个核苷酸的非编码小分子RNA。其在生物的进化、发育、细胞增殖、细胞凋亡以及疾病的发生方面发挥着重要的调控作用。本文就目前已测得的硬蜱small RNA数据库中miRNA相关信息进行分析,旨在为miRNA的发生、作用机理以及对生命机体的影响研究提供参考依据。方法:本研究基于已建立的硬蜱small RNA的数据平台,分析了不同类型miRNA在相同蜱种不同发育阶段以及不同蜱种相同发育阶段的表达谱特征,并分析其可能的差异表达情况以及miR NA的碱基偏向性。结果:分析发现,诸如mi R-1、mi R-10、Bantam等miRNA在蜱的各个阶段都有高丰度的表达。推测这些miRNA可能对蜱的基本生理功能具有重要的意义。此外,mi R-1345、mi R-796、mi R-279等只在蜱的特定阶段有较高的表达,且不同蜱种之间存在表达差异。碱基偏向性结果分析表明,U在所有miRNAD的首位占据较高的比率,而中间主要偏向于C+G的组合,末尾主要以A的碱基为主要序列。这一特点为了解miRNA的酶切位点以及酶切强度具有重要的意义。结论:miRNA在蜱的生理过程中扮演着重要的生理功能,以上数据的分析为我们了解生物调控因子的多样性,以及物种进化差异有着积极的参考价值。为进一步研究蜱虫基因生理功能的调控提供依据。
引文