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1.SH2B1 modulates chromatin state and MyoD occupancy to enhance expressions of myogenic genes

作者：Kuan-Wei Chen^a ; Yu-Jung Chang^a ; Chia-Ming Yeh^c ; Yen-Ling Lian^a ; Michael W.Y. Chan^c ; Cheng-Fu Kao^d ; Linyi Chen^a ; ^b ; ^{lchen@life.nthu.edu.tw}

关键词：Chromatin ; Differentiation ; Histone modifications ; Myogenesis ; Transcriptional regulation

刊名：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms

出版年：2017

2.Quantitative telomeric chromatin isolation protocol for human cells

作者：Jana Majerská ; Sophie Redon ; Joachim Lingner ; ^{joachim.lingner@epfl.ch}

关键词：Telomeres ; Chromatin ; Mass spectrometry ; Affinity purification ; SILAC

刊名：Methods

出版年：2017

3.A Multi-step Transcriptional and Chromatin State Cascade Underlies Motor Neuron Programming from Embryonic Stem Cells

作者：Silvia Velasco¹ ; ⁷ ; Mahmoud M. Ibrahim² ; ³ ; ⁷ ; Akshay Kakumanu⁴ ; ⁷ ; Gö ; rkem Garipler¹ ; Begü ; m Aydin¹ ; Mohamed Ahmed Al-Sayegh¹ ; ⁵ ; Antje Hirsekorn³ ; Farah Abdul-Rahman¹ ; Rahul Satija¹ ; ⁶ ; Uwe Ohler² ; ³ ; ^{uwe.ohler@mdc-berlin.de} ; Shaun Mahony⁴ ; ^{mahony@psu.edu} ; Esteban O. Mazzoni¹ ; ⁸ ; ^{eom204@nyu.edu}

关键词：direct programming ; neuron ; motor neuron

刊名：Cell Stem Cell

出版年：2017

4.Cell-Type-Specific Chromatin States Differentially Prime Squamous Cell Carcinoma Tumor-Initiating Cells for Epithelial to Mesenchymal Transition

作者：Mathilde Latil¹ ; ⁶ ; Dany Nassar¹ ; ⁶ ; Benjamin Beck¹ ; Soufiane Boumahdi¹ ; Li Wang² ; Audrey Brisebarre¹ ; Christine Dubois¹ ; Erwin Nkusi¹ ; Sandrine Lenglez¹ ; Agnieszka Checinska¹ ; Alizé ; e Vercauteren Drubbel¹ ; Michael Devos³ ; ⁴ ; Wim Declercq³ ; ⁴ ; Rui Yi² ; Cé ; dric Blanpain¹ ; ⁵ ; ⁷ ; ^{cedric.blanpain@ulb.ac.be}

关键词：skin cancer ; cancer cell of origin ; EMT ; epigenetic ; gene regulatory network ; cancer cell plasticity ; tumor heterogeneity ; cellular reprogramming ; transcription factors

刊名：Cell Stem Cell

出版年：2017

5.Human PRE-PIK3C2B, an intronic cis-element with dual function of activation and repression

作者：Jayant Maini^a ; Mohsen Ghasemi^a ; Deepti Yandhuri^b ; Suman S. Thakur^b ; Vani Brahmachari^a ; ^{vani.brahmachari@gmail.com}

关键词：Human PRE-TRE ; MLL ; Regulation ; Polycomb and trithorax ; Chromatin interaction ; Genetic interaction

刊名：Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Gene Regulatory Mechanisms

出版年：2017

6.Prenatal nutrition and the risk of adult obesity: Long-term effects of nutrition on epigenetic mechanisms regulating gene expression

作者：Estanislau Navarro^a ; ^{enavarro@idibell.cat} ; ^{estanis.navarro@gmail.com} ; Anna N. Funtikova^b ; ^c ; ^d ; Montserrat Fí ; to^b ; ^e ; Helmut Schrö ; der^b ; ^c

关键词：AS-RNA ; antisense RNA ; BAT ; brown adipose tissue ; BET ; bromodomain and extraterminal ; BMI ; body mass index ; CAD ; coronary artery disease ; CVD ; cardiovascular diseases ; DHA ; docosahexaenoic acid ; DMR ; differentially-methylated region ; DNMTs ; DNA methyltransferases ; DOAD ; developmental origins of adult disease ; DWF ; Dutch Winter Famine ; EGCG ; (&minus ; )-epigallocatechin gallate ; eRNAs ; enhancer RNAs ; ERV ; endogenous retrovirus ; GEN ; genistein ; HAT ; histone acetyl transferase ; HDAC ; histone deacetyl

刊名：The Journal of Nutritional Biochemistry

出版年：2017

7.Simultaneous Transcriptional and Epigenomic Profiling from Specific Cell Types within Heterogeneous Tissues In Vivo

作者：Hyun Cheol Roh¹ ; Linus T.-Y. Tsai¹ ; Anna Lyubetskaya¹ ; Danielle Tenen¹ ; Manju Kumari¹ ; Evan D. Rosen¹ ; ² ; ³ ; ⁴ ; ^{erosen@bidmc.harvard.edu}

关键词：epigenomics ; ChIP-seq ; RNA-seq ; NuTRAP ; adipocyte

刊名：Cell Reports

出版年：2017

8.DNA Occupancy of Polymerizing Transcription Factors: A Chemical Model of the ETS Family Factor Yan

作者：C. Matthew Hope¹ ; Ilaria Rebay² ; ³ ; ^{irebay@uchicago.edu} ; John Reinitz² ; ⁴ ; ⁵ ; ^{reinitz@galton.uchicago.edu}

刊名：Biophysical Journal

出版年：2017

9.Partially Assembled Nucleosome Structures at Atomic Detail

作者：Georgy N. Rychkov¹ ; ² ; Andrey V. Ilatovskiy¹ ; ³ ; Igor B. Nazarov⁴ ; Alexey V. Shvetsov¹ ; ⁵ ; Dmitry V. Lebedev¹ ; Alexander Y. Konev¹ ; Vladimir V. Isaev-Ivanov¹ ; Alexey V. Onufriev⁶ ; ^{alexey@cs.vt.edu}

刊名：Biophysical Journal

出版年：2017

10.Soil Primes the Seed: Epigenetic Landscape Drives Tumor Behavior

作者：Ramon J. Whitson¹ ; Anthony E. Oro¹ ; ^{oro@stanford.edu}

刊名：Cell Stem Cell

出版年：2017

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