鳜鱼(Sinipercachuatsi)β-肌动蛋白基因cDNA
全序列与5侧翼区的克隆与分析*
- 出版年：2009
- 作者：刘秀霞；梁旭方王琳；端金霞；李光照；廖婉琴
- 单位1：暨南大学生命科学技术学院
- 学历：硕士
- 语种：中文
- 作者关键词：β-肌动蛋白基因；cDNA序列；5调控区；克隆；鳜鱼
- 起始页：102
- 总页数：7
- 经费资助：国家自然科学基金项目，30670367号：广东省自然科学基金项目，031886号；国家高技术研究发展计划项目(863)
- 刊名：海洋与湖沼
- 是否内版：否
- 刊频：双月刊
- 创刊时间：1957
- 主办单位：中国海洋湖沼学会；中国科学院海洋研究所
- 主编：相建海
- 地址：青岛南海路7号
- 邮编：266071
- 电子信箱：chenpuyuan@yahoo.cn
- 卷：40
- 期：1
- 期刊索取号：P226.06 449
摘要
采用RT-PCR及RACE法，分离、克隆鳜鱼β-肌动蛋白基因cDNA全序列，再用基因组步行法(Genome Walker)克隆鳜鱼β-肌动蛋白基因5调控区。序列分析结果表明，鳜鱼β-肌动蛋白基因全长1897bp，其中5-UTR长94bp，3-UTR长675bp，编码区长1128bp，编码375个氨基酸。将所得序列与其它动物类群的β-肌动蛋白基因序列进行比较分析显示，鱼类、两栖类、鸟类、哺乳类等不同类群脊椎动物β-肌动蛋白氨基酸序列同源性均在96%以上，说明该基因在生物进化过程中高度保守。通过鳜鱼与其它脊椎动物β-肌动蛋白基因的核苷酸序列构建的进化树显示，脊椎动物β-肌动蛋白聚类成3个分支，鱼类β-肌动蛋白基因形成一个独立的分化群，说明鱼类β-肌动蛋白基因起源于一个共同祖先。克隆得到的鳜鱼β-肌动蛋白基因5侧翼序列长1399bp，对其进行序列分析，在其起始密码字ATG上游200bp范围内发现含有CAAT box、CC(A/T)6GG(CArG box)、TATA box对转录调控起重要作用的顺式元件，同时在侧翼区也发现含有GC box、MYOD、YY1、SP1、GATA等多个潜在调控元件。鳜鱼β-肌动蛋白基因5 侧翼序列的克隆成功，为今后转基因鳜鱼的研究工作奠定了基础。