藻类△6脂肪酸脱饱和酶基因密码子偏好性分析
- 出版年：2010
- 作者：赵薇；陈必链；王明兹；黄建忠
- 单位1：福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心
- 出生年：1984
- 学历：硕士
- 语种：中文
- 作者关键词：藻类；△6脱饱和酶基因；密码子偏好性；聚类分析
- 起始页：126
- 总页数：9
- 经费资助：福建省教育厅项目（JA09061）；福建省科技厅重点项目（200710039，200810047）；教育部留学回国人员科研启动基金资助项目
- 刊名：热带海洋学报
- 是否内版：否
- 刊频：双月刊
- 创刊时间：1982
- 主管单位：中国科学院
- 主办单位：中国科学院南海海洋研究所
- 主编：张偲
- 地址：广州市新港西路164路
- 邮编：510301
- 电子信箱：jto@scsio.ac.cn;journal@mail.sciencep.com
- 网址：http://jto.scsio.ac.cn;http://www.jto.ac.cn
- 卷：29
- 期：3
- 期刊索取号：P226.06 842
- 数据库收录：中国自然科学核心期刊；中国科学引文数据库来源期刊；中国学术期刊综合评价数据库来源期刊；已入网“万方数据——数字化期刊群”
- 核心期刊：中国自然科学核心期刊
摘要
△6脂肪酸脱饱和酶是在长链脂肪酸18C位置上引入双键的关键酶。本文分析硅藻门、绿藻门和蓝藻门等藻类的△6脂肪酸脱饱和酶基因密码子偏好及碱基位置偏好，同时比较藻类△6脂肪酸脱饱和酶基因与大肠杆菌、酵母及拟南芥基因组的密码子偏爱性。结果发现，硅藻门T.pseudonana与P.tricornutum及绿藻门Ostreococcustauri△6脂肪酸脱饱和酶基因明显偏爱使用以G或C结尾的密码子，GC含量高达61.61%。蓝藻门三种藻△6脂肪酸脱饱和酶基因与之相反，偏爱A或U结尾的密码子，GC含量仅为39.1%。所选9条不同藻类的△6脱饱和酶基因密码子偏好不明显，说明藻类物种间差异对△6脱饱和酶基因密码子偏好性的影响较小，在进化上较为保守。然而，藻类△6脱饱和酶基因密码子用法与大肠杆菌、酵母和拟南芥的△6脱饱和酶基因密码子用法差异较大，若要实现该基因在以上宿主中的高效表达则需对部分密码子进行改造。