广西候鸟H5N6亚型流感病毒的序列分析

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• 论文作者：李雪梅 ; 颜健华 ; 覃雨阳 ; 姚晓云 ; 熊毅 ; 罗廷荣
• 年：2016
• 作者机构：广西大学动物科学技术学院动物传染病实验室;广西动物疫病预防控制中心;
• 论文关键词：流感病毒 ; 候鸟 ; H5N6亚型 ; 序列分析
• 会议召开时间：2016-09-18
• 会议录名称：第六届中国兽药大会论文集
• 英文会议录名称：Proceedings of 2016 the 6th China Congress of Veterinary Medicine
• 语种：中文
• 分类号：S852.65
• 学会代码：ZGXJ
• 会议名称：第六届中国兽药大会
• 会议地点：中国四川成都
• 主办单位：中国兽医药品监察所、中国兽药协会
• 学会名称：中国畜牧兽医学会
• 页数：2
• 文件大小：145k
• 原文格式：O
• 会议级别：全国

摘要

本研究采用RT-PCR的方法对广西桂林、百色、北海3个地方采集的候鸟的粪便棉试纸进行流感病毒的检测,从234份粪便样品中检测出4份阳性,阳性率为1.71%;其中一份来自桂林的样品,通过8个基因片段的克隆和序列测定,鉴定为H5N6亚型禽流感病毒,命名为A/Little egret/Guang xi/G1/2014(简称G1)。其中HA、NA、M、NP、NS、PA、PB1、PB2的核苷酸ORF分别为1704bp、1380bp、982bp、1497bp、823bp、2151bp、2274bp和2280bp。G1与中国鸭源分离株A/duck/Eastern China/S0908/2014/H5N6的核苷酸和氨基酸同源性都在99%以上。通过氨基酸的序列分析发现,G1在HA的5个受体结合位点分别为103(H)、182(N)、221(G)、222(Q)、224(G)比较保守,与参考毒株序列一致,其中222位的氨基酸为Q,具有与禽流感唾液酸受体SAa-2,3-Gal结合的特性。HA氨基酸裂解位点为(-RERRRKGGLF-),具有高致病禽流感的特点,与参考株的裂解位点(-RERRRKRGLF-)相比,345为氨基酸由R突变为G。说明G1属于高致病性禽流感,但是否具有感染哺乳动物的能力,还有待进一步的研究:NA在59-70位氨基酸位点的缺失,与其他H5N6亚型流感病毒株一致,目前这部分的缺失还没有进一步的研究。另外NA在116、117、119、222、274、292和314位点并没有发生变异,说明G1对奥司他韦敏感;G1的M2蛋白的31位氨基酸为S,没有发生突变所以对金刚烷胺类的药物没有抗性。NS蛋白的80~84、38、41、42、103、106、149和191~195都没有发生致病力增强的突变;PB2蛋白致病力增强的位点为627、701、714,并未发生突变;NP蛋白的184位点由A突变为K,表示H5N6亚型病毒的繁殖力和致病力都有进一步增强;另外致病性相关位点中PB1蛋白氨基酸375、436、622位和PA蛋白的515位都比较保守,只有PB1蛋白的709位为V,PA蛋白的315位为F,显示该病毒没有致死位点的突变,但对小鼠的致病力有增强。氨基酸的潜在糖基化位点分析表明,G1的HA蛋白的糖基化位点共有10个,NA蛋白有9个潜在的糖基化位点,其中HA在第100位和170位氨基酸位点比参考毒株多出两个潜在的糖基化位点,NA在第40位和41位氨基酸位点处比参考毒株多出两个潜在的糖基化位点,而其余的糖基化位点都比较保守。耐药性基因位点分析中,NA和M基因都没有发现有抗药性位点的突变,说明G1对奥司他韦和金刚烷胺类的药物都敏感。通过对G1的8个基因片段的同源性和进化树分析显示,HA来源于南方水禽大分支中的2.3.4.4小分支,NA、M、NP、NS、PA、PB1、PB2片段都来源于欧亚系。综上所述,G1的所有片段都来自A/duck/Eastern-China/S0908/2014(H5N6)毒株构成的新的基因型。

引文