猪基因组选择网络平台介绍
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- 论文作者：宋海亮 ; 唐邵青 ; 张金鑫 ; 李乐义 ; 肖炜 ; 张勤 ; 丁向东
- 年：2016
- 作者机构：中国农业大学动物科学技术学院农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室国家畜禽育种工程实验室;北京畜牧总站;
- 论文关键词：猪 ; 基因组选择 ; 软件 ; 网络平台
- 会议召开时间：2016-10-20
- 会议录名称：中国畜牧兽医学会信息技术分会2016年学术研讨会文献
- 语种：中文
- 分类号：S828
- 学会代码：ZGXJ
- 会议名称：中国畜牧兽医学会信息技术分会2016年学术研讨会
- 会议地点：中国山东东营
- 主办单位：中国农业大学、中国畜牧兽医学会信息技术分会、中国农业工程学会
- 学会名称：中国畜牧兽医学会
- 页数：7
- 文件大小：3465k
- 原文格式：O
- 会议级别：全国
摘要
家畜育种在畜牧业发展过程中扮演着极具重要的作用,在现代育种中,随着基因芯片技术的成熟,大量的芯片得到开发并广泛应用,基于芯片技术的基因组选择技术越来越受到广泛关注。由于可以利用覆盖整个基因组的信息,基因组选择准确性相较于传统的育种方法要高,可以实现早期选种、准确预测,也可大大缩短世代间隔,加快了遗传进展。通常基因组选择实施中涉及芯片数据管理、芯片填充、育种值估计、反应变量计算、针对不同性状模型特异的基因组育种值估计等流程,繁琐而复杂。基于此,本研究以猪为例,开发了基因组选择网络平台系统,能够整合高密度SNP芯片信息,系谱信息、性能测定信息,使常规育种与分子育种无缝衔接,操作更加简单、方便。
引文
[1]Meuwissen T H E,Hayes B J,Goddard M E.Prediction of total genetic value using genome-wide dense marker maps.Genetics,2001,57(4):1819~1829.
[2]Goddard,M.E.and B.J.Hayes.Genomic selection.Journal of Animal Breeding and Genetics,2007,124(6):323-30.
[3]Ding X.,Z.Zhang,X.Li,S.Wang,X.Wu,Y.Yu,D.Sun,J.Liu,Y.Wang,Y Zhang,S.Zhang,Y.Zhang,Q.Zhang.Accuracy of genomic prediction for milk production traits in Chinese Holstein.populationusing a reference population consisting of cows.Journal of dairy science 2013,96(8):5315-5323
[4]IBANEZ-ESCRICHE N,FORNI S,NOGUERA J L,et al.Genomic information in pig breeding:Science meets industry needs[J].Livest Sci,2014(6):25.
[5]王青来,李亚兰.全国首例全基因组选择选育特级种猪在粤诞生[J].农业知识,2014(6):25.
[2]Goddard,M.E.and B.J.Hayes.Genomic selection.Journal of Animal Breeding and Genetics,2007,124(6):323-30.
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