CD44基因敲除引起小鼠肠道微生物宏基因组学的改变及防止实验性自身免疫性脑脊髓炎的发生

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• 论文作者：管红兵 ; 郑志超 ; 侯丹 ; 李正茂 ; 吴丽红
• 年：2016
• 作者机构：广州医科大学附属口腔医院广州口腔疾病研究所口腔医学重点实验室;
• 论文关键词：CD44 ; 肠道微生物 ; 微生物平衡紊乱 ; 实验性自身性脑脊髓炎
• 会议召开时间：2016-11-04
• 会议录名称：第十一届全国免疫学学术大会壁报交流集
• 英文会议录名称：Proceedings of 2016 CSI Congress on Immunology
• 语种：中文
• 分类号：R744.51
• 学会代码：IGMD
• 会议名称：第十一届全国免疫学学术大会
• 会议地点：中国安徽合肥
• 主办单位：中国免疫学会
• 学会名称：中国免疫学会
• 页数：1
• 文件大小：1225k
• 原文格式：D
• 会议级别：全国

摘要

背景:肠道微生物的平衡紊乱与多种炎症和自身免疫性疾病的发生有关。目的:我们实验室前期研究证实了CD44分子在实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)发生发展中的调节作用,在本报告中,我们进一步研究CD44的作用是否与肠道微生物的平衡有关。方法和结果 :我们发现将来源于CD44KO小鼠的粪便转移到CD44WT小鼠中,可以防止CD44WT小鼠发生EAE;而将来源于CD44WT小鼠的粪便转移到CD44WT小鼠中,不能防止CD44WT小鼠发生EAE。利用高通量基因测序技术测定粪便样本中16S r DNA可变区V3序列,将获得的原始测序数据进行拼接、过滤、去除嵌合体后与RDP数据库比对,筛选并去除污染(叶绿体、线粒体的16S r DNA序列)及不相关的序列(包括古生菌及真菌的16S r DNA序列),将获得的高质量序列在97%相似水平上进行OTU聚类,经物种注释后,对物种在各个分类水平上的丰度、Alpha多样性(样本内多样性)、Beta多样性(样本间差异性)进行分类学分析。结果表明:在门的分类水平上,经EAE诱导的CD44KO小鼠与CD44WT小鼠相比,在物种多样性、丰富度和均匀度上差异显著;其中CD44KO小鼠中拟杆菌门为主要菌群,占68.5%,厚壁菌门含量较低,占26.8%。结果进一步显示在CD44KO小鼠的粪便中短链脂肪酸(SCFAs)的组成和含量较之CD44WT小鼠有着显著的差异,其中丙酸和i-丁酸的变化最为显著。结论 :总结起来,我们的研究证实CD44基因敲除可以改变肠道微生物的平衡,进而影响到EAE的发病。

引文