西太平洋深海沉积物古菌多样性垂直分布

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• 出版年：2010
• 作者：王峰；萨仁高娃；李铁刚；马学恩；于心科
• 单位1：内蒙古农业大学动物科学与医学学院
• 出生年：1983
• 学历：硕士研究生
• 语种：中文
• 作者关键词：西太平洋；16S rDNA；沉积物多样性
• 起始页：1105
• 总页数：8
• 经费资助：本文为中国科学院知识创新工程重要方向项目(编号KZCX2-YW-211-03、KZCX2-YW-JC201-02)；中国科学院知识创新工程领域前 沿项目(编号MGE2008KG06)资助成果。
• 刊名：地质学报
• 是否内版：否
• 刊频：月刊
• 创刊时间：1922
• 主管单位：中国科学技术协会
• 主办单位：中国地质学会
• 主编：陈毓川
• 地址：北京阜成门外百万庄路26号
• 邮编：100037
• 电子信箱：dizhixuebao@163.com
• 卷：84
• 期：16
• 期刊索取号：P206.3141

摘要

以提取并纯化的西太平洋深海沉积物DNA为模板，利用古菌PCR特异性引物扩增出样品中古菌的16SrDNA片段，构建其克隆文库，建立阳性克隆子RFLP(Restriction Fragment Length Polymor-phism)酶切图谱。据酶切图谱对所获得的120个克隆进行测序，并与数据库中的序列进行比对，从而进行古菌的多样性和系统发育分析．结果表明，沉积物中扩增的16SrDNA古菌序列分别来自泉古生菌(Crenarchaeota)和广古生菌(Euryarchaeota)，以Marine Benthic Group B(11.8%)、Marine Benthic Graup D(13.6%)、Marine CrenarchaeoticGroup(68.69%)为主。少量序列为South African Gold Mine Euryarchaeotic Group(1.07%)、Deep-SeaHydrothermal Vent Euryarchaeotic Group(1.61%)、UⅡB(1.25%)、VALⅢ(1.79%)、Maririe Benthic Group E(0.18%)。以上结果表明西太平洋深海沉积物中有丰富多样的古菌群落。