应用DGGE技术分析扇贝养殖海区真核浮游生物种群多样性

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• 出版年：2010
• 作者：王娜；蔡玉勇；李赟；王崇明；崔红
• 单位1：中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室
• 出生年：1983
• 学历：硕士
• 语种：中文
• 作者关键词：PCR-DGGE；18S rDNA序列；真核浮游生物多样性
• 起始页：51
• 总页数：6
• 经费资助：国家高技术研究发展计划项目（2006AA100307）；现代农业产业技术体系建设专项（nycytx-4）资助
• 刊名：中国海洋大学学报（自然科学版）
• 是否内版：否
• 刊频：月刊
• 创刊时间：1959
• 主管单位：中华人民共和国教育部
• 主办单位：中国海洋大学
• 主编：管华诗
• 地址：青岛市鱼山路5号
• 邮编：266003
• 卷：40
• 期：12
• 期刊索取号：P226.066 110-1
• 数据库收录：中国科学技术信息研究所核心期刊；中国科学院文献情报中心核心期刊；北京大学图书馆核心期刊；CA 美国 《化学文摘》；AJ 俄罗斯 《文摘杂志》；ZR 英国 《动物学记录》；MR 美国 《数学评论》；ZM 德国 《数学文摘》；CSA 美国 “剑桥科学文摘社网址”之 水科学与渔业文摘C 海洋文摘，污染文摘C 环境科学与污染管理C 接卸工程文摘S 机械与运输工程文摘S 土木工程文摘S
• 核心期刊：中国科学技术信息研究所核心期刊；中国科学院文献情报中心核心期刊；北京大学图书馆核心期刊

摘要

为分析扇贝养殖海区真核浮游生物种类和丰度，本研究首先以实验室培养的9种饵料微藻总DNA为模板PCR扩增18SrDNAV1～V3区的高变区序列，筛选用于DGGE分析该扩增序列的变性剂浓度，结果表明，扩增序列长560bp，DGGE分析可将不同藻种分离开。随后对青岛沙子口扇贝养殖海区9个月份真核浮游生物多样性进行了DGGE分析，结果从9个月份2m深的海水中总共扩增出38条谱带，其中共有谱带3条，占总数的7.69%，不同月份的特征性谱带11个，占总谱带数的28.2%。不同月份水样中的谱带数显著不同，香农多样性指数为0.4632。相似性分析表明，2009年3和4月养殖海区真核微生物种类相似性最高，为89.7%。基于不同月份水样微生物种类多样性进行UPGMA聚类分析，结果表明，2008年5，6，8月和2009年1，2，3，4月分别聚为一支，显示取样时间相近的月份微生物种类相似度最高。