南海北部巴士海峡深海沉积物中细菌多样性分析

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• 出版年：2010
• 作者：孙慧敏；戴世鲲；王广华；谢练武；李翔
• 单位1：中国科学院海洋生物可持续利用重点实验室
• 单位2：中科院研究生院
• 出生年：1984
• 学历：硕士
• 语种：中文
• 作者关键词：南海；深海沉积物；细菌多样性
• 起始页：41
• 总页数：6
• 经费资助：国家“973”计划项目（2010CB833801），广东省科技计划项目（2008A030203004）和中科院引进国外杰出人才项目（百人计划）
• 刊名：热带海洋学报
• 是否内版：否
• 刊频：双月刊
• 创刊时间：1982
• 主管单位：中国科学院
• 主办单位：中国科学院南海海洋研究所
• 主编：张偲
• 地址：广州市新港西路164路
• 邮编：510301
• 电子信箱：jto@scsio.ac.cn;journal@mail.sciencep.com
• 网址：http://jto.scsio.ac.cn;http://www.jto.ac.cn
• 卷：29
• 期：3
• 期刊索取号：P226.06 842
• 数据库收录：中国自然科学核心期刊；中国科学引文数据库来源期刊；中国学术期刊综合评价数据库来源期刊；已入网“万方数据——数字化期刊群”
• 核心期刊：中国自然科学核心期刊

摘要

从南海北部巴士海峡深海沉积物中提取到高质量的总DNA，通过TA克隆构建了含有23个可操作分类单元（OTU）的16S rRNA基因文库，选择各OTU中代表性克隆子进行测序与系统发育分析，结果表明，南海北部巴士海峡深海沉积物中细菌在系统进化树中至少分属于9个类群：其中放线菌Actinobacteria，变形细菌Proteobacteria，和浮霉菌Planctomycetes为优势种；其他细菌如疣微菌Verrucomicrobia，鞘脂杆菌Sphingobacteria，硝化螺旋菌门（Nitrospira），绿弯菌Chloroflexi，厚壁菌Firmicute，酸杆菌Acidobacteria等为非优势种群；另外有两个克隆子属于未知种群。在所获得的23个代表克隆子序列中，有11个序列与已知细菌的同源性≤95%，占到了所有序列的48%，这一结果说明在南海北部巴士海峡海区具有非常丰富的微生物多样性，这一海区蕴含着大量未知的微生物资源，因而值得进行进一步的研究探索。