基于PCR-DGGE技术分析东南沿海城市水产品的细菌群落结构

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• 英文论文题名：Analysis and comparison of the bacterial diversity of aquatic products in the southeast coastal city by PCR-DGGE
• 论文作者：牛丽 ; 巴永兵 ; 刘海泉 ; 潘迎捷 ; 赵勇
• 英文论文作者：Niu Li ; Ba Yongbing ; Liu Haiquan ; Pan Yingjie ; Zhao Yong ; College of Food Science and Technology ; Shanghai Ocean University ; Shanghai Engineering Research Center of Aquatic-Product Processing & Preservation ; Laboratory of Quality & Safety Risk Assessment for Aquatic Products on Storage and Preservation(Shanghai) ; Ministry of Agriculture
• 年：2016
• 作者机构：上海海洋大学食品学院;上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心;农业部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海);
• 论文关键词：PCR-DGGE ; 16SrRNA ; 微生物多样性 ; 水产品
• 英文论文关键词：PCR-DGGE ; 16SrRNA ; microorganism diversity ; aquaticproduct
• 会议召开时间：2016-11-09
• 会议录名称：中国食品科学技术学会第十三届年会论文摘要集
• 英文会议录名称：Abstracts of the 13th Annual Meeting of CIFST
• 语种：中文
• 分类号：TS254.7
• 学会代码：ZGSP
• 会议名称：中国食品科学技术学会第十三届年会
• 会议地点：中国北京
• 主办单位：中国食品科学技术学会
• 学会名称：中国食品科学技术学会
• 页数：2
• 文件大小：102k
• 原文格式：O
• 会议级别：全国

摘要

微生物群落在食品质量和安全中起着重要的作用,被认为是导致食品腐败和食源性疾病的主要原因。基于PCR-DGGE的变性梯度凝胶电泳和16SrRNA基因克隆文库进行分析,对东南沿海的五个城市(上海、杭州、福建、宁波、福州)水产品进行检测。结果表明:变形菌门、厚壁菌门在五个城市中占主要地位,五个城市的水产品中都检测出弧菌属、巨球菌属。上海检测出不动杆菌属最多;其中发光杆菌属在厦门、福州作被检测;肠球菌属、气单胞菌属分别在杭州、宁波被大量检测出。香农-威纳指数表明细菌多样性具有显著差异,其中宁波最为明显。应用该方法在细菌群落的分析可以帮助我们更好地了解水产品中细菌的多样性和分布,为水产品中风险评估提供了参考。
Microbial community plays a prominent role in food quality and safety,which was regarded as the major cause for food spoilage and foodborne disease,.PCR-based denaturing gradient gel electrophoresis(DGGE) and 16 SrRNA gene library analysis were performed to analyze the bacterial community of aquaticproduct infive cities(Shanghai,Hangzhou,Fujian,Ningbo,Fuzhou) in the southeast coast.The results of DGGE profiles showed that Proteobacteria,Firmicutes dominated in five cities,Vibrio sp、 Enterococcus sp existed in five cities.Shanghai detected Acinetobacter sp most;where in Photobacteriumsp in Xiamen.,Fuzhou,;Enterococcus sp 、 Aeromonas spdetectedin Hangzhou,Ningbo respectively.Shannon-Wiener index showed significant difference in bacterial diversity,which is most evident in Ningbo.In conclusion,this study provides an effective tool foranalysis of bacterial community,might help us better understand the diversity and distribution of bacteria in aquaticproduct,This study provided references for the risk assessment of Vibrio parahaemolyticus.

引文