西太平洋深海沉积物古菌多样性垂直分布

详细信息   

• 责任者：王峰^c内蒙古农业大学^d1983^e硕士研究生 ; 萨仁高娃^c中国科学院青岛海洋研究所海洋地质与环境重点实验室 ; 李铁刚 ; 马学恩 ; 于心科
• 刊名：地质学报
• 出版年：2010
• 卷期：84^b8
• 关键词：深海沉积物 ; 细菌12^a西太平洋20^a生态环境 ; 生物多样性 ; 深海环境30^a古菌群落
• 页码：1105～1111
• 索书号：P206.3/141
• 图表：^c表3参22插图
• 分类号：0700,0910
• 文摘期号：2011/02

摘要

以提取并纯化的西太平洋深海沉积物DNA为模板，利用古菌PCR特异性引物扩增出样品中古菌的16S rDNA片段，构建其克隆文库，建立阳性克隆子RFLP(Restriction Fragment Length Polymor‐phism)酶切图谱。据酶切图谱对所获得的120个克隆进行测序，并与数据库中的序列进行比对，从而进行古菌的多样性和系统发育分析。结果表明，沉积物中扩增的16S rDNA古菌序列分别来自泉古生菌(Crenarchaeota)和广古生菌(Euryarchaeota)，以Marine Benthic Group B(11.8%)、Marine Benthic Group D(13.6%)、Marine Crenarchaeotic Group(68.69%)为主。少量序列为South African Gold Mine Euryarchaeotic Group(1.07%)、Deep‐Sea Hydrothermal Vent Euryarchaeotic Group(1.61%)、UIIB(1.25%)、VALIII(1.79%)、Marine Benthic Group E(0.18%)。以上结果表明西太平洋深海沉积物中有丰富多样的古菌群落。