小黄鱼(Larimichthys polyactis）线粒体基因组结构与特征
- 出版年：2010
- 作者：柳淑芳；吴仁协；朱玲；庄志猛
- 单位1：山东省渔业资源与生态环境重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所
- 职称：副研究员
- 语种：中文
- 作者关键词：小黄鱼；线粒体基因组；比较进化
- 起始页：885
- 总页数：10
- 经费资助：国家自然科学基金项目，40776097号，31061160187号；国家高技术研究发展计划项目，2009AA09Z401号；山东省泰山学者工程专项，2009.03—2014.02。
- 刊名：海洋与湖沼
- 是否内版：否
- 刊频：双月刊
- 创刊时间：1957
- 主办单位：中国海洋湖沼学会 中国科学院海洋研究所
- 主编：相建海
- 地址：《海洋与湖沼》编委会
- 邮编：266071
- 电子信箱：chenpuyuan@yahoo.cn
- 卷：41
- 期：6
- 期刊索取号：P226.06449
摘要
采用长片段扩增策略，获得鲈形目石首鱼科黄鱼属小黄鱼的线粒体基因组全序列。组装分析结果表明，其长度为16470bp，H链碱基组成呈明显反G偏倚，G含量仅为16%。13个蛋白质基因起始密码子均为ATG。COI基因的终止密码子为AGA，ND1和ND3基因为TAG，COII、ND4和Cytb基因为不完全终止密码子T，其余7个基因都是完整的TAA。在小黄鱼mtDNA中发现2个特殊发夹结构，一个是轻链复制起始区(OL)的发夹环，位于tRNA簇，环区T含量仅为9%，而G含量达45%，这与哺乳动物和爪蟾该区域富含T有所不同。另一个假定发夹结构位于ATP6基因末端，这种二级结构可能与准确转录有关。该mtDNA控制区长度为799bp，5′端含有9个连续TA串联重复和2个5′-ATGTA—TACAT-3′重复，与已报道的鱼类扩展终止相关序列模式恰恰相反；中央控制区仅识别出CSB-E结构；保守序列区含有CSB-1，2，3，其中CSB-2具有高度保守性。对小黄鱼和大黄鱼的mtDNA比较进化研究，根据分子钟假说，估计二者线粒体基因组的进化分歧时间为4.8百万年前。