东海原甲藻(Prorocentrum donghaiense)和海洋原甲藻APBM(P.micans APBM)的5.8SrDNA及其转录间隔区(ITS)的克隆和序列分析
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  • 出版年:2004
  • 作者:张宝玉;王广策;张炎;韩笑天;吕颂辉;齐雨藻;邹景忠;曾呈奎
  • 单位1:中国科学院海洋研究所
  • 职称:博士研究生
  • 语种:中文
  • 作者关键词:东海原甲藻;海洋原甲藻;ITS;序列分析;系统进化
  • 起始页:264
  • 总页数:9
  • 经费资助:国家自然科学基金面上资助项目,30170499号;中国科学院知识创新重要方向性项目。KZCX2-211号;国家973项目“我国赤潮高发区赤潮生物多样性及其种群分布特征”,2001CB409701号
  • 刊名:海洋与湖沼
  • 是否内版:否
  • 刊频:双月刊
  • 创刊时间:1957
  • 主办单位:中国海洋湖沼学会
  • 主编:相建海
  • 地址:青岛南海路7号
  • 邮编:266071
  • 电子信箱:bsun@ms.qdio.ac.cn
  • 卷:35
  • 期:3
  • 期刊索取号:P\226.06\449
摘要
对东海原甲藻( Prorocentrum donghaiense)和海洋原甲藻APBM (P.micans APBM)的5.8S rDNA及其转录间隔区(ITS)序列进行了PCR扩增、克隆和序列测定,并分析了甲藻属9株赤潮藻(7株从GenBank获得)的系统进化关系。结果表明,海洋原甲藻APBM的ITS片段(含5.8S区)为631bp,东海原甲藻的(含5.8S区)为552bp;东海原甲藻与从GenBank中获得的微小原甲A相似程度较高,与甲藻属其他原甲藻相似程度较低;本文研究的海洋原甲藻APBM的ITS序列与其他原甲藻相似程度都较低并且在进化树上距离也较远。用ITSI或ITS2序列构建的系统树与用ITS+5.8S rDNA序列构建的系统树反映的结果基本一致,5.8S区因过于保守似乎不适于构建系统树反映种下的亲缘关系。

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