Identification par exome de 2 biomarqueurs génétiques rares fortement associés à la pelade

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• 作者：I. Malek¹ ; ² ; ; M. Benfodda³ ; V. Descamps⁴ ; A. Bensussan⁵ ; N. Bou Ali¹ ; M. Denguezli⁶ ; A. Saad¹ ; L. Boussofara⁶ ; C.-B. Boileau³ ; P. Reygagne⁷ ; M. Gribaa¹ ; N. Soufir³
• 关键词：SEC31A ; MPZL3 ; Maladie auto-immune ; Pelade
• 刊名：Annales de Dermatologie et de Vénéréologie
• 出版年：2016
• 出版时间：December 2016
• 年：2016
• 卷：143
• 期：12_supp_S
• 页码：S173
• 全文大小：50 K
• 卷排序：143

文摘

La pelade est une dermatose alopéciante non cicatricielle acquise. C’est une maladie multifactorielle, associant des mécanismes auto-immunes et une prédisposition génétique. Sa prévalence est estimée à 0,1–0,2 %. Une composante génétique forte est remarquable du fait de la fréquence des formes familiales (20 %). Cette maladie, par son caractère affichant, a un retentissement psychologique important sur la qualité de vie du patient. Le but de cette étude était d’identifier de nouveaux gènes de susceptibilité à la pelade.Matériel et méthodesUne étude d’exome (Kit Agilent R All Exon V5, séquenceur Hi Seq 1000 Illumina) a été effectuée chez 12 patients (2 familles avec deux membres atteints et 8 patients porteurs de pelades sévères sporadiques). Après analyse biostatistique des variants, nous avons sélectionné une dizaine de SNPs rares (fréquence allélique < 1 %) candidats qui étaient présents chez au moins 3/10 malades non apparentés. Ces SNPs ont été génotypés dans une cohorte de 303 patients et 987 contrôles sains, par séquençage Sanger. La fréquence des mutations a été comparée à celle des témoins ainsi qu’à celle présente dans la base de données Exac.RésultatsL’analyse des exomes permettait notamment d’identifier une mutation d’épissage, située dans l’exon 22 du gène SEC31A c.2968 + 1G > T (rs78735860), et une mutation faux sens dans l’exon 4 du gène MPZL3 c.463A > G (rs17121966), présente chacune chez 3 individus non apparentés. De plus, ces 2 mutations ségrégaient dans une famille. Ces deux mutations ont été par la suite génotypées par séquençage Sanger chez les malades et les témoins. La comparaison de la fréquence de ces variants chez les patients et les témoins suggère une forte association au risque de pelade : SEC31A (rs78735860) : p value < 0,0001, OR 9,74 (2,42–45,45) ; rs17121966 (MPZL3), p value = 0,003, OR 9,52 (1,74–68,30).DiscussionLe gène SEC31A est localisé sur le chromosome 4q21.22, code pour une protéine de 1221 AAs d’expression ubiquitaire. SEC31A joue un rôle important dans le système immunitaire via la présentation de l’antigène du peptide exogène par le CMH de classe I. Le gène MPZL3 est localisé sur le chromosome 11q23.3, et code pour une protéine de 236 AAs. MPZL3 joue un rôle majeur comme régulateur de la différenciation de l’épiderme. Chez la souris, un rôle complexe du gène MPZL3 a été démontré dans le contrôle du développement de la peau et de la croissance des cheveux. Ces 2 gènes pourraient donc avoir un rôle important dans la physiopathologie de la pelade via soit le système immunitaire soit probablement dans le cycle pilaire.ConclusionNos résultats montrent que certaines mutations de SEC31A et MPZL3 prédisposent fortement à la pelade. Le séquençage de l’ensemble de la séquence codante de ces gènes est en cours afin d’identifier potentiellement d’autres variants délétères.