Les biobanques ou centres de ressources biologiques (CRB) sont les maillons essentiels de la recherche translationnelle. Ces structures bénéficient de financements publics récurrents afin d’établir des collections d’échantillons biologiques utilisées dans le cadre de projets de recherche. Plus de 100 biobanques ont été développées sur le territoire national au sein des hôpitaux universitaires et des centres de lutte contre le cancer. Le développement de nouvelles techniques et de nouvelles méthodes d’analyses dans la recherche médicale bouleversent les pratiques et soulèvent de nouveaux défis scientifiques et organisationnels dans la collecte, la transformation et la conservation des échantillons. Relever ces défis devient un enjeu primordial pour les biobanques. La mise en place d’une stratégie dynamique pour anticiper les besoins des utilisateurs est nécessaire et repose sur de nouveaux modes de fonctionnement. Cet article décrit les enjeux à court et à moyen terme pour les biobanques françaises et propose des éléments d’organisation pour y répondre.