En el hipotiroidismo cong¨¦nito transitorio, las causas principales son, durante el parto, la sobrecarga yodada que puede experimentar el feto por pincelaciones antis¨¦pticas con povidona yodada y la v¨ªa materna, y en el per¨ªodo de reci¨¦n nacido (fen¨®meno de Wolf-Chaikoff), la inmadurez del sistema hipot¨¢lamo-hipofisario que condiciona una deficiencia de funcionalismo del tiroides del prematuro, m¨¢s aun si se trata de un prematuro patol¨®gico, y una relativa deficiencia de yodo en las f¨®rmulas de la leche.
En el hipotiroidismo cong¨¦nito definitivo las principales etiolog¨ªas son las mutaciones que ocurren en los factores de transcripci¨®n y en el complejo enzim¨¢tico preciso para la formaci¨®n de hormonas tiroideas (dishormonog¨¦nesis).
Hoy se conocen una serie de factores de transcripci¨®n: FOXE I (TITF 2), NK X2.1 (TITF 1), PAX 8 y Shh (en ratones) cuyas mutaciones son causa de las disgenesias tiroideas, aunque expliquen s¨®lo un peque?o porcentaje de ellas.
Dentro de las dishormonog¨¦nesis est¨¢n bien estudiadas las mutaciones de la mayor¨ªa de los trastornos enzim¨¢ticos que ocurren tanto en el borde basocelular como en el apical del tirocito, y que ocasionan un hipotiroidismo cong¨¦nito con gl¨¢ndula normosituada.
El hipotiroidismo cong¨¦nito definitivo ha pasado de ser considerado como una simple embriopat¨ªa o malformaci¨®n a una entidad de gran inter¨¦s en los estudios de biolog¨ªa molecular para conocer el entramado de genes que son precisos para el normal funcionamiento de la gl¨¢ndula.