:
– analyser par biologie moléculaire les altérations du gène SMARCB1 dans les chordomes BAF47-déficients en immunohistochimie ;
– valider, chez l’enfant, le score immunohistopronostique défini chez l’adulte ;
– établir un algorithme pronostique tenant compte du statut SMARCB1 des chordomes.
Étude rétrospective multicentrique avec relecture histologique et réalisation d’un panel d’immunomarquages comprenant brachyurie, Ki67, p53, E-cadherine, EGFR, VEGF, PTEN, pSTAT3 et BAF47. Analyse par technique MLPA (mulitplex ligation dependent probe amplification assay) et séquençage du gène SMARCB1. Analyse par FISH afin de rechercher une délétion du gène pour les prélèvements non contributifs en MLPA.
L’analyse immunohistochimique a révélé une expression de STAT3p, VEGF, EGFR et une perte de PTEN significative sans corrélation avec le pronostic. Une délétion du gène SMARCB1 a été mise en évidence par MLPA dans 2 cas (3 cas non contributifs en MLPA et en FISH). De façon significative, nous proposons un algorithme pronostique dans lequel les chordomes BAF47-déficients sont ceux ayant le pronostic le plus péjoratif. Dans les chordomes BAF47-conservés, le score immunohistopronostique défini chez l’adulte s’applique mais permet ici de distinguer, de façon significative, trois grades (bas, intermédiaire et haut), corrélés avec la survie globale et la survie sans progression (p = 0,0007 et < 0,0001).
Nos résultats montrent que la perte d’expression de BAF47 est liée à une délétion et non une mutation du gène SMARCB1. L’algorithme proposé, utilisable en routine distingue :
– les chordomes au pronostic le plus sévère (BAF47-déficients), ce qui les rapproche d’autres tumeurs présentant une altération du complexe SWI/SNF également grevées d’un pronostic péjoratif (tumeurs rhabdoïdes et tératoïdes atypiques avec altérations de SMARCB1, méningiomes à cellules claires avec altérations de SMARCE1) ;
– trois grades pour les chordomes BAF47-conservés.
Notre série de chordomes pédiatriques permet d’établir un algorithme pronostique pertinent pouvant modifier la prise en charge et le suivi de ces tumeurs malignes au profil évolutif variable.