Épidémiologie moléculaire du virus de l’hépatite C (VHC) chez les donneurs de sang français entre 2008 et 2011. Caractérisation de génomes complets du VHC appartenant au génotype 2

详细信息    查看全文

• 作者：F. Jordier ; ^{edme.jordier@efs.sante.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; M.-L. Deligny ; R. Barré ; P. De Micco ; J.-F. Cantaloube
• 关键词：Virus de l&rsquo ; hé ; patite C ; Donneurs de sang ; Distribution sous-types ; Facteur de risques ; Gé ; notype 2 complet ; Phylogé ; nie ; Insertion
• 刊名：Transfusion Clinique et Biologique
• 出版年：2015
• 出版时间：September 2015
• 年：2015
• 卷：22
• 期：4
• 页码：270
• 全文大小：216 K

文摘

La distribution des génotypes du virus de l’hépatite C (VHC) chez les donneurs de sang français entre 2008 et 2011 a été analysée. Le génotypage des souches a permis d’identifier la diversité des génotypes circulants. Les sous-types 1a, 1b et 3a sont majoritairement retrouvés (80 % des souches). L’analyse phylogénétique a démontré une grande variabilité chez les types 2 et 4 représentés par de nombreux sous-types. Les résultats montrent que les comportements à risque tendent à influencer et redessiner la distribution de ces génotypes dans la population générale. Certains sous-types se répandent dans des groupes à risque où ils finissent par adopter un profil épidémique. Les données épidémiques obtenues ont été enrichies de nouvelles connaissances sur l’évolution et la classification du VHC. Quinze génomes complets de souches appartenant au type 2 ont été caractérisés et séquencés. L’analyse phylogénétique révèle 2 clusters distincts dans le type 2. Le cluster 1 comprend la plupart des souches analysées tandis que le cluster 2 comprend le sous-type 2l. Les génomes obtenus ont un ORF de 9042 à 9108 bases (3014 à 3036 acides aminés). Les distances moyennes entre sous-types sont égales à 20 % dans le cluster 1 et 26 % entre les deux clusters. La bifurcation entre clusters a eu lieu tôt lors de l’évolution du virus. Une insertion de 60 bases dans la région NS5A, caractéristique du type 2, n’est pas retrouvée dans le cluster comprenant le sous-type 2l, suggérant une apparition et une fixation tardive de celle-ci lors de l’évolution du virus.