Genetic Drivers of Epigenetic and Transcriptional Variation in Human Immune Cells
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- 作者：Lu Chen1 ; 2 ; 28 ; Bing Ge3 ; 28 ; Francesco Paolo Casale4 ; 28 ; Louella Vasquez1 ; 28 ; Tony Kwan3 ; Diego Garrido-Martí ; n5 ; 6 ; Stephen Watt1 ; Ying Yan1 ; Kousik Kundu1 ; 2 ; Simone Ecker7 ; 8 ; Avik Datta9 ; David Richardson9 ; Frances Burden2 ; 18 ; Daniel Mead1 ; Alice L. Mann1 ; Jose Maria Fernandez7 ; Sophia Rowlston2 ; 18 ; Steven P. Wilder10 ; Samantha Farrow2 ; 18 ; Xiaojian Shao3 ; John J. Lambourne3 ; 2 ; 18 ; Adriana Redensek3 ; Cornelis A. Albers13 ; 16 ; Vyacheslav Amstislavskiy14 ; Sofie Ashford2 ; 18 ; Kim Berentsen15 ; Lorenzo Bomba1 ; Guillaume Bourque3 ; David Bujold3 ; Stephan Busche3 ; Maxime Caron3 ; Shu-Huang Chen3 ; Warren Cheung3 ; Oliver Delaneau12 ; Emmanouil T. Dermitzakis12 ; Heather Elding1 ; Irina Colgiu17 ; Frederik O. Bagger2 ; 4 ; 18 ; Paul Flicek9 ; Ehsan Habibi15 ; Valentina Iotchkova1 ; 11 ; Eva Janssen-Megens15 ; Bowon Kim15 ; Hans Lehrach14 ; Ernesto Lowy9 ; Amit Mandoli15 ; Filomena Matarese15 ; Matthew T. Maurano19 ; John A. Morris3 ; Vera Pancaldi7
- 关键词：immune ; monocyte ; neutrophil ; t-cell ; EWAS ; histone modification ; DNA methylation ; transription ; allele specific ; QTL
- 刊名：Cell
- 出版年：2016
- 出版时间：17 November 2016
- 年：2016
- 卷：167
- 期：5
- 页码：1398-1414.e24
- 全文大小：10465 K
文摘
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Genome, transcriptome, and epigenome reference panel in three human immune cell types
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Identified 4,418 genes associated with epigenetic changes independent of genetics
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Described genome-epigenome coordination defining cell-type-specific regulatory events
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Functionally mapped disease mechanisms at 345 unique autoimmune disease loci