Clarigo^® : un nouveau test de dépistage prénatal non invasif (DPNI) des trisomies 13, 18 et 21 (T13, T18 et T21) par séquençage d’amplicons

详细信息    查看全文

• 作者：Laetitia Gouas^a ; ^{lgouas@chu-clermontferrand.fr" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author} ; Eleonore Eymard-Pierre^b ; Stephan Ké ; mé ; ny^b ; Cé ; line Pebrel-Richard^b ; Carole Goumy^b ; Philippe Vago^b
• 关键词：Dé ; pistage pré ; natal non invasif ; Trisomie 21 ; Sé ; quenç ; age haut dé ; bit
• 刊名：Morphologie
• 出版年：2016
• 出版时间：September 2016
• 年：2016
• 卷：100
• 期：330
• 页码：175
• 全文大小：50 K

文摘

Clarigo^® (Multiplicom) est un nouveau test de DPNI des T13, T18 et T21. Il s’agit d’une approche ciblée reposant sur le séquençage massif parallèle de séquences spécifiques de ces chromosomes. Nous rapportons les résultats de nos premiers essais pour la validation du test dans notre service.

bsSec_2">Matériel et méthode

36 échantillons (4 T21, 1 T18 et 31 témoins négatifs) ont été analysés. L’ADN circulant a été extrait (Blood DNA circulating, Qiagen). Vingt microlitres ont été utilisés pour la PCR multiplexe. Les produits amplifiés ont été purifiés pour servir de matrice à la PCR universelle (ajout de MID spécifiques à chaque échantillon). Après purification et contrôle de la qualité de la PCR, les échantillons ont été dosés et mélangés de façon équimolaire. Le pool a ensuite été séquencé (V3 MiSeq, Illumina). Les données ont été traitées avec le logiciel Clarigo Reporter^® (Multiplicom).

bsSec_3">Résultats

Pour 3 des 4 échantillons T21, la trisomie 21 a été détectée ; pour le 4^e, le logiciel a conclu à « non automatiquement classé » (NAC). Parmi les 32 autres échantillons (1T18 et 31 témoins), 3 (dont le T18) présentaient une fraction fœtale trop faible pour donner un résultat fiable. Pour les 29 autres, l’analyse s’est révélée négative pour la T21 et « NAC » une fois pour la T18 et trois fois pour la T13.

bsSec_4">Conclusions

Les premiers résultats sont satisfaisants avec une bonne sensibilité pour la trisomie 21 et une très bonne spécificité. Pour les échantillons classés « NAC », l’analyse des graphes a permis de suspecter la trisomie 21 sur le 4^e échantillon T21 et d’écarter une telle T21 pour les 4 témoins. Sur les 3 échantillons à faible fraction fœtale, 2 provenaient de femmes enceintes présentant un indice de masse corporelle ≥ 35, confirmant ce facteur comme limitant à la réalisation du test.