Faecalibaterium的禽类特异性生物标记引物在珠三角地区的灵敏度和特异性研究

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• 作者：贾乐华王海鹰吴仁人王菊芳
• 会议时间：2014-08-01
• 关键词：污染治理 ; 畜禽养殖业 ; 微生物源解析技术 ; 生物标记引物 ; 检测灵敏度 ; 特异性分析
• 作者单位：贾乐华,王海鹰,王菊芳(华南理工大学生物科学与工程学院,广东广州,510006)吴仁人(环境保护部华南环境科学研究所,广东 广州,510640;广东省水与大气污染防治重点实验室,广东广州,510640)
• 母体文献：2014中国环境科学学会学术年会论文集
• 会议名称：2014中国环境科学学会学术年会
• 会议地点：成都
• 主办单位：中国环境科学学会
• 语种：chi
• 分类号：R28;R44

摘要

据珠三角地区的畜禽养殖情况,采集猪、牛、羊以及家禽等101个粪便样品,高效提取基因组DNA,通过对DNA提取结果的分析,得出珠三角地区的主要畜禽动物中,使用粪便基因组DNA提取试剂盒对猪的粪便基因组DNA的提取效果最好,对牛的粪便基因组DNA的提取效果最差.为验证引物地区特异性,选取5种特异性Faecalibaterium引物进行敏感度和特异性检验.结果表明:Faecalibaterium通用引物B2(FAU-F/FAU-R)检出率为90.8%(59/65),特异性为100%,适合在珠三角地区使用.鸡的特异性引物B3(FaCH-F1/ FaCH-R1)和B4(FaCH-F2/ FaCH-R2)敏感度较差,鸭的特异性引物B5(FaDH-F1/FaDH-R1)和B6(FaDH-F2/FaDH-R2)特异性较差,在目标研究区域均不具备良好的适用性.研究亦证明同一引物在不同地区具有不同的敏感度和特异性,在引入非目标地设计的引物时应进行PCR扩增验证.