太湖地区菜地土壤微生物群落的遗传多样性分析
- 作者：滕齐辉曹慧崔中利王英孙波郝红涛李顺鹏
- 会议时间：2005-08-14
- 关键词：土壤微生物 ; 菌体细胞回收 ; 16S rDNA基因文库 ; 遗传多样性 ; 未培养微生物 ; 变形杆菌
- 作者单位：滕齐辉,曹慧,王英,李顺鹏(南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室,南京,210095)崔中利(南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室,南京,210095;中国科学院南京土壤研究所,南京,210008)孙波,郝红涛(中国科学院南京土壤研究所,南京,210008)
- 母体文献：第八次全国环境微生物学术研讨会论文集
- 会议名称：第八次全国环境微生物学术研讨会
- 会议地点：哈尔滨
- 主办单位：中国微生物学会
- 语种：chi
摘要
土壤微生物多样性是土壤生态功能的基础.采用间接法提取太湖地区菜地土壤微生物的总DNA,以细菌的特异性引物扩增16SrDNA片段,扩增产物与T-载体酶连,转化大肠杆菌,建立土壤微生物16SrDNA基因文库.PCR扩增基因文库中插入的16SrDNA外源片段,用两种限制性内切酶HhaⅠ和RasⅠ分别酶切,获得该土壤173个克隆的酶切指纹图谱.结果表明,HhaⅠ和RasⅠ联合酶切产生63个基因分型,文库的覆盖度达76.3%,单一酶切产生的基因分型少,但文库的覆盖度高;克隆文库中存在两种优势类群,分别占总克隆的16%和12%;16SrDNA测序结果表明,太湖地区菜地土壤微生物在分类方面主要属于α-和γ-变形杆菌亚门,未培养的微生物类群占有较大的比例.