一株硫酸盐还原菌的16S rRNA基因鉴定及亚硫酸盐还原酶基因序列分析
- 作者：赵阳国任南琪王爱杰程玉鹏赵秋实万春黎
- 会议时间：2005-08-14
- 关键词：硫酸盐还原菌 ; 脱硫弧菌F28-1 ; 16S rRNA基因 ; 亚硫酸盐还原酶基因 ; 基因鉴定 ; 基因序列 ; 硫酸盐废水处理
- 作者单位：赵阳国,任南琪,王爱杰,赵秋实,万春黎(哈尔滨工业大学市政环境工程学院,哈尔滨,150090)程玉鹏(哈尔滨师范大学生物系,哈尔滨,150080)
- 母体文献：第八次全国环境微生物学术研讨会论文集
- 会议名称：第八次全国环境微生物学术研讨会
- 会议地点：哈尔滨
- 主办单位：中国微生物学会
- 语种：chi
摘要
采用硫酸盐还原菌(SRB)快速筛检技术从硫酸盐废水处理反应器中分离到多株SRB,对其中一株F28-1的16SrRNA基因和异化型亚硫酸盐还原酶(DSR)基因进行了克隆测序分析.RDP和Blastn分类检索表明F28-1为Desulfovibrio属的菌株,其16SrRNA基因序列同Desulfovibriodesulfuricanssubsp.DesulfuricansstrainEssex6(AF192153)的相似性达99.9%,故命名该菌株为脱硫脱硫弧菌F28-1;对PCR产物克隆测序得到DSR基因部分序列1948bp,ORFfinder分析表明序列包含2个ORFs:dsrA和dsrB,二者相似性为14%.根据核酸序推导出相应的α-亚基和β-亚基,α-亚基含有典型的亚硝酸盐-亚硫酸盐还原酶保守框架:与唏咯铁卟啉(siroheme)相结合的(C-X5-C)-Xn-(C-X3-C)框架,与Fe4S4基团相结合的CP-Xn-C-X2-C-X2-C保守框架,而β-亚基只含有与Fe4S4基团相结合的完整CP-Xn-C-X2-C-X2-C保守结构.酶结构的详细分析为定量检测提供靶位点以及提高SRB在硫酸盐废水处理中代谢能力等方面奠定了理论基础.