胡姬花和君子兰内生细菌的16S rDNA-RFLP多样性及系统发育分析

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• 作者：智菡菡隋新华陈文新
• 会议时间：2006-08-16
• 关键词：花卉 ; 内生细菌 ; 16S rDNA-RFLP ; 系统发育 ; 胡姬花 ; 君子兰
• 作者单位：中国农业大学生物学院/农业部农业微生物资源及其应用重点开放实验室,100094
• 母体文献：第九次全国环境微生物学术研讨会论文摘要集
• 会议名称：第九次全国环境微生物学术研讨会
• 会议地点：杭州
• 主办单位：中国微生物学会
• 语种：chi

摘要

本文采用NA和TSA两种培养基从胡姬花、君子兰两种花卉的根和叶组织中分离到60株内生细菌,其中6株分离自胡姬花,54株分离自君子兰.16SrDNA-RFLP多样性分析表明,所有菌株产生33种rType型,胡姬花内生细菌共有5种rType型,北京君子兰的24株内生细菌有11种rType型,长春君子兰的30株内生细菌共有15种rType型.胡姬花、北京君子兰和长春君子兰都具有各自独特的rType类型和优势rType类型,说明宿主和来源地类型与内生细菌的遗传型具有相关性.选取4个rType类型的代表菌株进行16S rDNA测序并构建其系统发育树,结果表明它们的系统发育地位都属于芽孢杆菌属,其中33号菌和Bacillus humi、Bacillus sporothermodurans、Bacillus acidicola的模式菌株的序列相似性最紧密,都大于97%;20号菌和Bacillus lichenformis的模式菌株的相似性最高,达到99.72%,26号菌和Bacillus subtilis的模式菌株相似性最高为99.21%,29号菌株和Bacillus firmus的模式菌株相似性最高,达到99.02%.