不同抽薹性萝卜遗传多样性的SSR分子标记分析
详细信息    查看全文 | 推荐本文 |
  • 英文篇名:Genetic diversity of radish(Raphanus sativus L.) with different bolting-resistance based on SSR markers
  • 作者:杨峰 ; 冉茂林 ; 李晓梅 ; 陈琳 ; 雍小平 ; 冉科
  • 英文作者:Yang Feng;
  • 关键词:萝卜 ; 抽薹 ; SSR标记 ; 遗传多样性
  • 中文刊名:JSNY
  • 英文刊名:Jiangsu Agricultural Sciences
  • 机构:四川省农业科学院水稻高粱研究所;蔬菜种质与品种创新四川省重点实验室;
  • 出版日期:2019-03-08 15:23
  • 出版单位:江苏农业科学
  • 年:2019
  • 期:v.47
  • 基金:四川省科技创新苗子工程资助项目(编号:2017078);; 四川省“十三五”财政创新能力提升工程项目(编号:2016ZYPZ-036);; 蔬菜种质与品种创新四川省重点实验室开放课题
  • 语种:中文;
  • 页:JSNY201904030
  • 页数:5
  • CN:04
  • ISSN:32-1214/S
  • 分类号:131-135
摘要
为了加强对耐抽薹萝卜种质资源的研究,加快耐抽薹萝卜育种进程,从206对SSR分子标记引物中筛选出21对,用于57份不同抽薹性萝卜材料进行遗传多样性分析。结果表明,PCR共扩增出102条条带,平均4.86条,每对引物2~9条带,其中具有多态性的为95条,多态性条带百分率为93.14%。POPGENE分析结果表明,平均观测等位基因数为2.967 4,平均有效等位基因数为2.419 1,有效等位基因比例为81.52%;平均Nei基因多样性指数为0.355 5,平均Shannon多态性指数为0.528 9。UPGMA法聚类结果把供试萝卜材料分为3个类群,5个亚类:第Ⅰ类为来源于德国的极耐抽薹材料,第Ⅱ类为来源于韩国和日本的耐抽薹材料,第Ⅲ类为来源于我国的材料,其中第3亚类共有45份,占材料总数的78.95%,第4亚类为5份极易抽薹材料,第5亚类仅有1份。各材料间平均遗传相似系数为0.638 1,变幅范围0.347 8~0.934 8,>0.7的仅22.87%,遗传差异较大。不同抽薹性萝卜材料所表现出的丰富多样性,对萝卜种质资源管理和耐抽薹品种选育具有重要意义。
        
引文
[1]方智远. 中国蔬菜育种学[M]. 北京:中国农业出版社,2017:703.
    [2]汪隆植,何启伟. 中国萝卜[M]. 北京:科学技术文献出版社,2005:1314.
    [3]唐荣华,张君诚,吴为人. SSR分子标记的开发技术研究进展[J]. 西南农业学报,2002,15(4):106-109.
    [4]王晓武,杜永臣. 蔬菜作物分子育种研究现状与趋势[J]. 中国农业科技导报,2007,9(2):14-18.
    [5]邱杨,李锡香,李清霞,等. 利用SSR标记构建萝卜种质资源分子身份证[J]. 植物遗传资源学报,2014,15(3):648-654.
    [6]王庆彪,张丽,郑鹏婧,等. 秋红萝卜SSR指纹图谱构建及其应用[J]. 分子植物育种,2015,13(8):1794-1801.
    [7]Masato T,Keita S,Nakao K,et al.Construction of a molecular linkage map of radish (Raphanus sativus L.),based on AFLP and Brassica-SSR markers[J]. Breeding Science,2005,55(1):107-111.
    [8]Ryoichi N,Tomoko H,Naoko M,et al.Development of genomic and EST-SSR markers in radish (Raphanus sativus L.)[J]. Breeding Science,2011,61(4):413-419.
    [9]Zhai L L,Xu L,Wang Y,et al.Novel and useful genic-SSR markers from de novo transcriptome sequencing of radish (Raphanus sativus L.)[J]. Molecular Breeding,2014,33(3):611-624.
    [10]Zhai L L,Liu L W,Zhu X W,et al.Development,characterization and application of novel expressed sequence tag- simple sequence repeat (EST-SSR) markers in radish (Raphanus sativus L.)[J]. African Journal of Biotechnology,2013,12(9):921-935.
    [11]李竟才,李世升,张娜娜,等. 白萝卜纯度鉴定的SSR分子标记筛选与鉴定[J]. 分子植物育种,2018,16(8):2525-2532.
    [12]张小康,朱运峰,陈玉霞,等. SSR分子标记技术在汉青一号萝卜种子纯度鉴定中的应用[J]. 湖北农业科学,2016,55(19):5069-5071.
    [13]韩晓雨. 萝卜雄性不育系及其保持系的生理生化分析和SSR标记研究[D]. 泰安:山东农业大学,2012.
    [14]付卫民,王淑芬,何启伟,等. 心里美萝卜肉质根内花青素相关基因的EST-SSR标记筛选[C]// 中国园艺学会十字花科蔬菜分会第十届学术研讨会论文集. 北京:中国园艺学会,2012:5.
    [15]Francis C Y,Rong C Y,Boyle T.POPGENE version 1.32,Microsoft windows-based freeware for population genetic analysis[M]. Edmonton:University of Alberta,1999:45-68.
    [16]Rohlf F.NTSYS-pc Version 2.1.Numerical taxonomy system and multivariate analysis system[M]. New York:Exeter Software,2002:57-66.
    [17]Masatoshi N.Molecular evolutionary genetics[M]. New York:Columbia University Press,1989:150-154.
    [18]Wang Q B,Zhang L,Zheng P J.Genetic diversity and evolutionary relationship analyses within and among Raphanus species using EST-SSR markers[J]. Molecular Breeding,2015,35:62.
    [19]方平,陈发波,姚启伦,等. 肉质色不同萝卜遗传多样性的SSR分子标记分析[J]. 植物遗传资源学报,2012,12(2):226-232.
    [20]陈文辉,方淑桂,曾小玲,等. 利用ISSR和SRAP标记分析耐抽薹大白菜的遗传多样性[J]. 热带作物学报,2011,32(10):1858-1863.
    [21]高颖,罗双霞,王彦华,等. 大白菜抽薹开花时间与SSR和InDel标记的关联分析[J]. 园艺学报,2012,39(6):1081-1089.
    [22]柳李旺,宋贤勇,龚义勤,等. 萝卜MSAP体系优化与抽薹过程中MSAP分析[J]. 江苏农业科学,2006(6):203-206.
    [23]刘哲,许园园,苏小俊. 萝卜抽薹相关SRAP分子标记筛选与分析[J]. 江苏农业科学,2016,44(8):74-76.孙翰昌,杨帆,郭玉阳. 斑点叉尾血液学指标及血细胞特点分析[J]. 江苏农业科学,2019,47(4):128-131.

© 2004-2018 中国地质图书馆版权所有 京ICP备05064691号 京公网安备11010802017129号

地址:北京市海淀区学院路29号 邮编:100083

电话:办公室:(+86 10)66554848;文献借阅、咨询服务、科技查新:66554700