火龙果茎基因组DNA提取方法改良
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摘要
火龙果(Hylocereus undulatus)是近年发展起来的一种新兴热带水果,其茎富含多糖、多酚及其它次生代谢物,黏性极大,很难从中提取高质量的DNA。特别是一年生以上的老茎,目前尚未有较好的DNA提取方法。为了解决这一难题,该研究对CTAB+Tris-HCl洗涤法进行了3种方式的改良。结果表明,"改进三"方法可不受取样时期和取样部位的限制,从一年生以上火龙果茎中提取的DNA质量最好且不含黏性物质,可用于酶切与分子标记等生化和分子生物学实验。该研究探索了一条较为理想的火龙果茎DNA提取方法,值得推广应用。
Pitaya(Hylocereus undulatus) is a tropical fruit developed in recent years. Because its stem is full of polysaccharides, polyphenols and other secondary metabolites, extracting high-quality DNA from the stem is difficult, especially from stems more than 1 year old. At present, there is no good method for DNA extraction. We examined three methods to improve DNA extraction based on the CTAB+Tris-HCl washing method for better and easier DNA extraction. The third method obtained the best-quality DNA without sticky substances from pitaya stem more than 1 year old and was not restricted by sampling data and sampling site. The extracted DNA can be used in enzyme digestion and inter-simple sequence repeat amplification experiments. Our study provides an ideal method for extracting DNA from pitaya stem, which is worth popularizing.
Pitaya(Hylocereus undulatus) is a tropical fruit developed in recent years. Because its stem is full of polysaccharides, polyphenols and other secondary metabolites, extracting high-quality DNA from the stem is difficult, especially from stems more than 1 year old. At present, there is no good method for DNA extraction. We examined three methods to improve DNA extraction based on the CTAB+Tris-HCl washing method for better and easier DNA extraction. The third method obtained the best-quality DNA without sticky substances from pitaya stem more than 1 year old and was not restricted by sampling data and sampling site. The extracted DNA can be used in enzyme digestion and inter-simple sequence repeat amplification experiments. Our study provides an ideal method for extracting DNA from pitaya stem, which is worth popularizing.
引文
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