基于模糊K近邻的miRNA表达谱数据分析
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  • 作者:梅端 ; 刘强
  • 中文刊名:ELEW
  • 英文刊名:Electronics World
  • 机构:广东海洋大学数学与计算机学院;广东海洋大学机械与动力工程学院;
  • 出版日期:2019-07-15
  • 出版单位:电子世界
  • 年:2019
  • 期:No.571
  • 基金:广东省教育厅创新强校工程(GDOU2016050228);; 广东省大学生创新创业训练计划(S201910566065)
  • 语种:中文;
  • 页:ELEW201913027
  • 页数:2
  • CN:13
  • ISSN:11-2086/TN
  • 分类号:52-53
摘要
<正>为了有效地解决肿瘤的二分类问题,首先采用Fisher准则法对miRNA表达谱数据集进行特征选择,然后利用模糊K近邻(FKNN)算法对待测样本进行分类,最后采用留一法交叉验证评估分类性能。与4种分类方法进行对比,实验结果表明:该方法在分类性能上具有优越性,即选取4个miRNAs生物标记物就能获得96.77%的分类精度,与此同时,AUC值为0.9732。
        
引文
[1]梅端.基于SVM-KNN分类器的miRNA表达谱分析[D].云南:云南大学,2014;
    [2]梅端,柴华金,黄江.一种改进的SVM算法对miRNA表达谱的分析[J].西北师范大学学报(自然科学版), 2016, 52(2);
    [3]Kim K J,Cho S B.Exploring features and classifiers to classify microRNA expression profiles of human cancer[C].17th International Conference Neural Information Processing,Sydney,Australia,2010,pp.234-241;
    [4]Tran D H,Ho T B,Pham T H,et al.MicroRNA expression profiles for classification and analysis of tumor samples[J].IEICE TRANSACTIONS on Information and Systems,2011,94(3):416-422。

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