摘要
火龙果(Hylocereus undulatus)是近年发展起来的一种新兴热带水果,其茎富含多糖、多酚及其它次生代谢物,黏性极大,很难从中提取高质量的DNA。特别是一年生以上的老茎,目前尚未有较好的DNA提取方法。为了解决这一难题,该研究对CTAB+Tris-HCl洗涤法进行了3种方式的改良。结果表明,"改进三"方法可不受取样时期和取样部位的限制,从一年生以上火龙果茎中提取的DNA质量最好且不含黏性物质,可用于酶切与分子标记等生化和分子生物学实验。该研究探索了一条较为理想的火龙果茎DNA提取方法,值得推广应用。
Pitaya(Hylocereus undulatus) is a tropical fruit developed in recent years. Because its stem is full of polysaccharides, polyphenols and other secondary metabolites, extracting high-quality DNA from the stem is difficult, especially from stems more than 1 year old. At present, there is no good method for DNA extraction. We examined three methods to improve DNA extraction based on the CTAB+Tris-HCl washing method for better and easier DNA extraction. The third method obtained the best-quality DNA without sticky substances from pitaya stem more than 1 year old and was not restricted by sampling data and sampling site. The extracted DNA can be used in enzyme digestion and inter-simple sequence repeat amplification experiments. Our study provides an ideal method for extracting DNA from pitaya stem, which is worth popularizing.
引文
陈明贤(2012).福建省火龙果种质资源ISSR分析及耐盐生理研究.硕士论文.福州:福建农林大学.pp.11-26.
程文,夏正俊,冯献忠,杨素欣(2016).一种快速、无损大豆种子DNA提取方法的建立和应用.植物学报51,68-73.
邓仁菊,范建新,蔡永强(2011).国内外火龙果研究进展及产业发展现状.贵州农业科学39(6),188-192.
董美超,岳建强,李进学,高俊燕(2013).火龙果育种研究进展.热带农业科学33(5),56-59.
冯建成(2006).分子标记辅助选择技术在水稻育种上的应用.中国农学通报22(2),43-47.
傅建敏,梁玉琴,孙鹏,姬燕晓,谭晓风(2015).柿属植物叶绿体DNA提取方法优化.中南林业科技大学学报35(12),25-28.
韩静丹,秦萌,王献(2012).铁线蕨总DNA提取方法比较分析.河南农业大学学报46,182-187.
李会,任志莹,王颖,王建忠(2013).不同DNA提取试剂盒提取作物种子基因组DNA效果的比较.湖北农业科学52,1956-1958.
李建生(2007).玉米分子育种研究进展.中国农业科技导报9(2),10-13.
李金璐,王硕,于婧,王玲,周世良(2013).一种改良的植物DNA提取方法.植物学报48,72-78.
梁雪莲,郑奕雄,陈晓玲,曾锦姬(2007).花生DNA提取方法比较.生物技术17,41-44.
罗焜,马培,姚辉,宋经元,陈科力,刘义梅(2012).中药DNA条形码鉴定中的DNA提取方法研究.世界科学技术--中医药现代化14,1433-1439.
罗小艳,郭璇华(2007).火龙果的研究现状及发展前景.食品与发酵工业33(9),142-145.
马小军,莫长明(2017).药用植物分子育种展望.中国中药杂志42,2021-2031.
邱丽娟,王昌陵,周国安,陈受宜,常汝镇(2007).大豆分子育种研究进展.中国农业科学40,2418-2436.
申世辉,马玉华,蔡永强(2015).火龙果研究进展.中国热带农业(1),48-52.
田新民,李洪立,何云,洪青梅,胡文斌,李琼(2015).火龙果研究现状.北方园艺(18),188-193.
吴丽圆(2004).4种思茅松总DNA提取方法的比较.福建林学院学报24,237-240.
吴琳(2016).火龙果种质资源评价及繁育研究.硕士论文.南宁:广西大学.pp.11-61.
吴敏娜,武亚琦,屈艳,魏纪东,钟根深(2015).四种小鼠肠道微生物DNA提取方法比较.生态学杂志34,1183-1188.
余志雄,欧高政,陈清西,袁亚芳(2010).火龙果总DNA提取方法比较研究.中国农学通报26,300-303.
詹少华,尹艺林(2008).大豆基因组DNA提取纯化方法研究.安徽农业科学36,9871-9872,9928.
张冰雪,范付华,乔光,宋莎,文晓鹏,刘涛(2013).贵州地方火龙果芽变种质DNA指纹图谱及遗传多样性的ISSR分析.果树学报30,573-577.
张芬,李达,吕长平,张力,冯岳东,许威,张宏志(2011).兰花SRAP指纹图谱的构建.湖南农业科学(3),129-132.
张桂春,刘玉静,李延敏,牟萍,曲明娟,李清,周菊华(2017).火龙果果皮中可溶性膳食纤维的提取方法.植物学报52,622-630.
张玉晶,李牡丹,石旭,关萍(2011).珙桐基因组DNA的提取及ISSR-PCR体系的优化.山地农业生物学报30(3),211-214.
郑育声,李东栋,王哲魁(2007).椰子不同组织基因组DNA的提取及质量分析.海南大学学报自然科学版25,51-56.
Kaczyńska A,?o?M,W?grzyn G(2013).An improved method for efficient isolation and purification of genomic DNA from filamentous cyanobacteria belonging to genera Anabaena,Nodularia and Nostoc.Oceanol Hydrobiol Stud 42,8-13.
Murray MG,Thompson WF(1980).Rapid isolation of high molecular weight plant DNA.Nucleic Acids Res 8,4321-4325.