鲫鱼金黄杆菌的分离、生理生化鉴定及分子生物学鉴定
|
摘要
为了鉴定从发病鲫鱼中分离出的优势菌株(菌株命名为L1),试验以细菌形态观察、生理生化特性分析等传统细菌鉴定法以及16S rDNA扩增和MEGA 5.0软件构建系统进化树的分子生物学鉴定法对优势菌株L1进行鉴定。结果表明:该菌株为不具有运动性的革兰氏阴性菌;生理生化鉴定结果显示与金黄杆菌基本一致;从L1菌株中获得长度为1 406 bp的16S rDNA基因,得到的Gen Bank登录号为KY460509;系统进化树分析显示,与金黄杆菌亲缘关系最近。说明从发病鲫鱼中分离出的优势菌株L1为金黄杆菌。
引文
[1]布坎南R E,吉本斯N E.伯杰细菌鉴定手册[M].8版.北京:科学出版社,1984.
[2]BERNARDET J F,SEGERS P,VANCA M,et al.Cutting a gordian knot:emended classification and description of the genus Flavobacterium,emended description of the family Flavobacteriaceae,and proposal of Flavobacterium hydatis nom.nov.(Basonym,Cytophaga aquatilis Strohl and Tait 1978)[J].Int J Syst Bacteriol,1996,46(1):128-148.
[3]董杰,张嵘,周宏伟,等.金黄杆菌属连续5年耐药性监测与β-内酰胺酶的检测[J].中华医院感染学杂志,2008,18(10):1476-1479.
[4]林祥宏,徐元宏,陈晓莉,等.金黄杆菌临床分离株β-内酰胺酶及耐药性分析[J].临床检验杂志,2007,25(5):361-363.
[5]BLOCH K C,NADARAJAH R,JACOBS R.Chryseobacterium meningosepticum:an emerging pathogen among immunocompromised adults.Report of 6 cases and literature review[J].Medicine,1997,76(1):30-41.
[6]王世瑜,穆红,刘晔华.172株产吲哚金黄杆菌的临床分布及耐药分析[J].山东医药,2013,53(24):84-85.
[7]王继元,周育,赖仞,等.1株金黄杆菌分离、鉴定及其胞外蛋白酶活性的初步研究[J].微生物学杂志,2010,30(1):21-26.
[8]王鑫毅,韩艳楠,金珊,等.乌鳢产吲哚金黄杆菌的鉴定及其胞外产物特性分析[J].水生生物学报,2016,40(3):641-646.
[9]赵天涛,何成明,张丽杰,等.矿化垃圾中金黄杆菌甲烷亲和氧化动力学[J].化工学报,2011,62(7):1915-1921.
[10]曾诚,范远鑫,丁少军.甾醇酯酶菌株Chryseobacterium sp.的筛选及酶学性质研究[J].林产化学与工业,2013,33(3):43-49.
[11]欧志龙,韩振为,张瑞玲,等.Chryseobacterium sp.降解β-环糊精包埋的甲基叔丁基醚[J].农业环境科学学报,2007,26(4):1459-1463.
[12]滕涛,梁利国,谢俊.大宗淡水鱼细菌性疾病研究进展[J].江苏农业科学,2015,43(11):8-12.
[13]张冬星,康元环,田佳鑫,等.鲫鱼源致病性维氏气单胞菌的分离鉴定及药敏试验[J].中国兽医科学,2017,47(3):366-374.
[14]徐珊红,王海鹏,韩克清.常规养殖鱼类细菌性疾病防治[J].畜牧兽医科技信息,2013(5):120.
[15]林福森.养殖鱼类常见细菌性疾病的防治[J].江西水产科技,2016(4):41-45.
[16]盛家和,肖伟强,许青霞.产吲哚金黄杆菌和黏金黄杆菌产β-內酰酶的研究[J].中华医院感染学杂志,2009,19(5):498-499.
[17]张嵘,周宏伟,陈功祥.脑膜败血金黄杆菌产金属β-内酰胺酶的检测及基因型的研究[J].中华微生物学和免疫学杂志,2006,26(8):734-738.
[18]鲁远彪.脑膜脓毒金黄杆菌肺炎1例[J].中国误诊学杂志,2002,2(12):1890-1891.
[19]张晓炜,宋佩茹,董云秋.脑膜脓毒性金黄杆菌致医院感染3例分析[J].中华医院感染学杂志,2002,12(10):794-795.
[20]徐亚林,李澄,张梦涵,等.脑膜炎脓毒金黄杆菌感染1例[J].国际检验医学杂志,2016,37(24):3527-3528.
[21]VANDAMME P,BERNARDET J F,SEGERS P,et al.New perspectives in the classification of the flavobacteria:description of Chryseobacterium gen nov,bergeyellagen nov,and empedobacter norn rev[J].IJSB,1994,44(4):827-831.
[22]董靖.无指盘臭蛙表皮金黄杆菌分离鉴定及胞外蛋白酶研究[D].南京:南京农业大学,2007.
[23]苟小兰,王利,黄艳青.黄颡鱼小肠结肠炎耶尔森氏菌16S r DNA及系统发育分析[J].水产生态学杂志,2012,33(5):94-100.
[24]李鹤,李兆利,刘思国,等.一株溶原性鸡大肠杆菌的分子特征鉴定[J].黑龙江畜牧兽医,2016(04上):27-29.
[25]冯方周,张晓东,安倩,等.辽西地区致病性鸡大肠杆菌的分离鉴定及16S rRNA序列分析[J].黑龙江畜牧兽医,2017(08上):191-195.
[2]BERNARDET J F,SEGERS P,VANCA M,et al.Cutting a gordian knot:emended classification and description of the genus Flavobacterium,emended description of the family Flavobacteriaceae,and proposal of Flavobacterium hydatis nom.nov.(Basonym,Cytophaga aquatilis Strohl and Tait 1978)[J].Int J Syst Bacteriol,1996,46(1):128-148.
[3]董杰,张嵘,周宏伟,等.金黄杆菌属连续5年耐药性监测与β-内酰胺酶的检测[J].中华医院感染学杂志,2008,18(10):1476-1479.
[4]林祥宏,徐元宏,陈晓莉,等.金黄杆菌临床分离株β-内酰胺酶及耐药性分析[J].临床检验杂志,2007,25(5):361-363.
[5]BLOCH K C,NADARAJAH R,JACOBS R.Chryseobacterium meningosepticum:an emerging pathogen among immunocompromised adults.Report of 6 cases and literature review[J].Medicine,1997,76(1):30-41.
[6]王世瑜,穆红,刘晔华.172株产吲哚金黄杆菌的临床分布及耐药分析[J].山东医药,2013,53(24):84-85.
[7]王继元,周育,赖仞,等.1株金黄杆菌分离、鉴定及其胞外蛋白酶活性的初步研究[J].微生物学杂志,2010,30(1):21-26.
[8]王鑫毅,韩艳楠,金珊,等.乌鳢产吲哚金黄杆菌的鉴定及其胞外产物特性分析[J].水生生物学报,2016,40(3):641-646.
[9]赵天涛,何成明,张丽杰,等.矿化垃圾中金黄杆菌甲烷亲和氧化动力学[J].化工学报,2011,62(7):1915-1921.
[10]曾诚,范远鑫,丁少军.甾醇酯酶菌株Chryseobacterium sp.的筛选及酶学性质研究[J].林产化学与工业,2013,33(3):43-49.
[11]欧志龙,韩振为,张瑞玲,等.Chryseobacterium sp.降解β-环糊精包埋的甲基叔丁基醚[J].农业环境科学学报,2007,26(4):1459-1463.
[12]滕涛,梁利国,谢俊.大宗淡水鱼细菌性疾病研究进展[J].江苏农业科学,2015,43(11):8-12.
[13]张冬星,康元环,田佳鑫,等.鲫鱼源致病性维氏气单胞菌的分离鉴定及药敏试验[J].中国兽医科学,2017,47(3):366-374.
[14]徐珊红,王海鹏,韩克清.常规养殖鱼类细菌性疾病防治[J].畜牧兽医科技信息,2013(5):120.
[15]林福森.养殖鱼类常见细菌性疾病的防治[J].江西水产科技,2016(4):41-45.
[16]盛家和,肖伟强,许青霞.产吲哚金黄杆菌和黏金黄杆菌产β-內酰酶的研究[J].中华医院感染学杂志,2009,19(5):498-499.
[17]张嵘,周宏伟,陈功祥.脑膜败血金黄杆菌产金属β-内酰胺酶的检测及基因型的研究[J].中华微生物学和免疫学杂志,2006,26(8):734-738.
[18]鲁远彪.脑膜脓毒金黄杆菌肺炎1例[J].中国误诊学杂志,2002,2(12):1890-1891.
[19]张晓炜,宋佩茹,董云秋.脑膜脓毒性金黄杆菌致医院感染3例分析[J].中华医院感染学杂志,2002,12(10):794-795.
[20]徐亚林,李澄,张梦涵,等.脑膜炎脓毒金黄杆菌感染1例[J].国际检验医学杂志,2016,37(24):3527-3528.
[21]VANDAMME P,BERNARDET J F,SEGERS P,et al.New perspectives in the classification of the flavobacteria:description of Chryseobacterium gen nov,bergeyellagen nov,and empedobacter norn rev[J].IJSB,1994,44(4):827-831.
[22]董靖.无指盘臭蛙表皮金黄杆菌分离鉴定及胞外蛋白酶研究[D].南京:南京农业大学,2007.
[23]苟小兰,王利,黄艳青.黄颡鱼小肠结肠炎耶尔森氏菌16S r DNA及系统发育分析[J].水产生态学杂志,2012,33(5):94-100.
[24]李鹤,李兆利,刘思国,等.一株溶原性鸡大肠杆菌的分子特征鉴定[J].黑龙江畜牧兽医,2016(04上):27-29.
[25]冯方周,张晓东,安倩,等.辽西地区致病性鸡大肠杆菌的分离鉴定及16S rRNA序列分析[J].黑龙江畜牧兽医,2017(08上):191-195.