东亚和北美裸大麦(青稞)籽粒硬度基因HINA的分子进化分析

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英文篇名：Molecular Evolution Analysis of Grain Hardness(HINA) Gene in Hulless Barley from Eastern Asia and Northern American 作者：刘新春 ; 赖运平 ; 余毅 ; 冯宗云 英文作者：LIU Xin-chun;LAI Yun-ping;YU Yie; 关键词：裸大麦(青稞) ; 籽粒硬度 ; HINA基因 ; 分子进化 中文刊名：DMKX 英文刊名：Barley and Cereal Sciences 机构：四川农业大学农学院作物遗传育种学系大麦青稞研究中心;成都农业科技职业学院;四川省农业科学院作物研究所/农业部植物新品种测试(成都)分中心; 出版日期：2018-07-09 18:20 出版单位：大麦与谷类科学 年：2018 期：v.35;No.139 基金：国家现代农业产业技术体系(大麦青稞体系)建设专项基金(CARS-05) 语种：中文; 页：DMKX201804016 页数：1 CN：04 ISSN：32-1769/S 分类号：60

摘要

随着现代经济社会的发展,裸大麦(青稞)的多元化加工也成为裸大麦(青稞)口粮外的另一类发展趋势,籽粒硬度是决定裸大麦加工用途的一个重要品质性状,HINA基因编码的HINA蛋白是影响籽粒硬度性状的一个重要蛋白。本研究通过对108份来自北美和东亚(中国青藏高原)6个地区裸大麦(青稞)HINA基因进行重测序,结果在群体序列中发现58个多态性位点(包括30个SNP和28个Indel),可以将群体序列分成13种单倍型。其中单倍型1(Hap1)和单倍型4(Hap4)是分布范围最为广泛的2种单倍型。各地区的单倍型多样性指数范围为0.000~0.833,总群体单倍型多样性指数为0.575,各地区核苷酸多样性系数范围为0.000~0.010,总群体的核苷酸多样性系数为0.007,6个地区群体的基因序列配对分化系数(Fst)范围为-0.08~0.16,分子方差分析显示东亚和北美群体的基因遗传变异主要是由群体内的变异为主(总群体中91.16%的基因变异来源于群体内,8.84%的变异来源于群体间)。群体结构分析将所有材料的HINA基因序列分成2个亚群群体。材料的地理来源与亚群分类相关性较低。利用中性检测及错配分析对选择压力与群体HINA基因遗传分化的关系进行考察,发现中性检验值在东亚(中国青藏高原)、北美和总群体中均为负值,同时群体错配曲线为多峰曲线,说明群体在HINA基因位点上是稳定群体,这些结果为了解HINA基因在裸大麦(青稞)遗传特征上的作用提供了理论依据。
        

引文