藏药波棱瓜属药用植物DNA条形码鉴定
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摘要
为评价DNA条形码候选序列对藏药波棱瓜属植物的鉴定作用,探讨波棱瓜属植物鉴定新方法,本研究采用不同产地、不同海拔波棱瓜植物的ITS2、PsbA-trnH、rbcL、matK通用引物对110份样品进行DNA提取、PCR扩增和测序,比较4条DNA序列扩增效率和测序成功率;分析种内和种间变异;通过Barcoding gap分析,构建NJ系统进化树,评价各序列对西藏自治区、云南省、四川省不同海拔波棱瓜药材的辨别能力。研究结果表明,ITS2序列在所研究的波棱瓜属药用植物中的扩增效率和测序成功率均为100%,其种内种间变异、Barcoding gap与其他DNA条形码候选序列相比具有明显的优势,以ITS2序列作为DNA条形码,可对波棱瓜进行准确、快速识别和鉴定,准确地弄清楚不同地区不同海拔所生长的波棱瓜之间的进化关系,为该药用植物的质量控制、安全用药及资源合理开发利用提供理论依据。
引文
[1]马哈也那,马世林,王振华,等.月王药诊[M].兰州:甘肃民族出版社,1993.
[2]顾健,李佳川,樊利娜.藏药波棱瓜子总木脂素对刀豆球蛋白(ConA)致免疫性肝损伤小鼠保护作用及其机制探讨[J].西南民族大学学报(自然科学版),2014,40(3):375-387,481.
[3]丛龙波,王琪,李仙义,等.藏药波棱瓜子抗肝炎药效物质基础研究[J].医学研究杂志,2007,3(8):75-76.
[4]Bhargava M,Sharma A.DNA barcoding in plants:evolution and applications of in silico approaches and resources[J].Molecular Phylogenetics and Evolution,2013,67(3):631-641.
[5]任瑶瑶,江南屏,刘睿颖,等.应用ITS2序列鉴定四川车前、平车前、大车前[J].江苏中医药,2017,49(5):57-60.
[6]朱英杰,陈士林,姚辉,等.重楼属药用植物DNA条形码鉴定研究[J].药学学报,2010,45(3):376-382.
[7]Yao H,Song J,Liu C,et al.Use of ITS2 region as the universal DNA barcode for plants and animals[J].PLoS One,2010,5(10):e13102.
[8]豆荣昆,毕振飞,白瑞雪,等.黄花紫堇、多刺绿绒蒿及其同属近缘物种的ITS2条形码鉴定与分析[J].中国中药杂志,2015,40(8):1453-1458.
[9]卢杰,兰小中,罗建.林芝地区珍稀濒危藏药植物资源调查与评价[J].资源科学,2011,33(12):2362-2369.
[10]关法春,王超,权红,等.西藏野生波棱瓜资源的调查和分类[J].西南农业学报,2011,24(2):832-834.
[11]Kress W J,Wurdack K J,Zimmer E A,et al.Use of DNA barcodes to identify flowering plants[J].Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,2005,102(23):8369-8374.
[12]魏星任,叶清莲,马新业,等.凉粉草DNA条形码通用序列的筛选及其混伪品分子鉴定[J].江苏农业科学,2017,45(13):32-35.
[13]刘政泽,刘博.基于ITS+matK序列探讨部分藤黄属植物的种间亲缘关系[J].江苏农业科学,2017,45(13):39-42.
[14]Chase M W,Cowan R S,Hollingsworth P M,et al.A proposal for a standardised protocol to barcode all land plants[J].Taxon,2007,56(2):295-299.
[15]Lahaye R,Van Der Bank M,Bogarin D,et al.DNA barcoding the floras of biodiversity hotspots[J].Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,2008,105(8):2923-2928.尹国友,王林嵩.猪流行性腹泻毒株S基因分离鉴定及序列分析[J].江苏农业科学,2019,47(11):71-74.
[2]顾健,李佳川,樊利娜.藏药波棱瓜子总木脂素对刀豆球蛋白(ConA)致免疫性肝损伤小鼠保护作用及其机制探讨[J].西南民族大学学报(自然科学版),2014,40(3):375-387,481.
[3]丛龙波,王琪,李仙义,等.藏药波棱瓜子抗肝炎药效物质基础研究[J].医学研究杂志,2007,3(8):75-76.
[4]Bhargava M,Sharma A.DNA barcoding in plants:evolution and applications of in silico approaches and resources[J].Molecular Phylogenetics and Evolution,2013,67(3):631-641.
[5]任瑶瑶,江南屏,刘睿颖,等.应用ITS2序列鉴定四川车前、平车前、大车前[J].江苏中医药,2017,49(5):57-60.
[6]朱英杰,陈士林,姚辉,等.重楼属药用植物DNA条形码鉴定研究[J].药学学报,2010,45(3):376-382.
[7]Yao H,Song J,Liu C,et al.Use of ITS2 region as the universal DNA barcode for plants and animals[J].PLoS One,2010,5(10):e13102.
[8]豆荣昆,毕振飞,白瑞雪,等.黄花紫堇、多刺绿绒蒿及其同属近缘物种的ITS2条形码鉴定与分析[J].中国中药杂志,2015,40(8):1453-1458.
[9]卢杰,兰小中,罗建.林芝地区珍稀濒危藏药植物资源调查与评价[J].资源科学,2011,33(12):2362-2369.
[10]关法春,王超,权红,等.西藏野生波棱瓜资源的调查和分类[J].西南农业学报,2011,24(2):832-834.
[11]Kress W J,Wurdack K J,Zimmer E A,et al.Use of DNA barcodes to identify flowering plants[J].Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,2005,102(23):8369-8374.
[12]魏星任,叶清莲,马新业,等.凉粉草DNA条形码通用序列的筛选及其混伪品分子鉴定[J].江苏农业科学,2017,45(13):32-35.
[13]刘政泽,刘博.基于ITS+matK序列探讨部分藤黄属植物的种间亲缘关系[J].江苏农业科学,2017,45(13):39-42.
[14]Chase M W,Cowan R S,Hollingsworth P M,et al.A proposal for a standardised protocol to barcode all land plants[J].Taxon,2007,56(2):295-299.
[15]Lahaye R,Van Der Bank M,Bogarin D,et al.DNA barcoding the floras of biodiversity hotspots[J].Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,2008,105(8):2923-2928.尹国友,王林嵩.猪流行性腹泻毒株S基因分离鉴定及序列分析[J].江苏农业科学,2019,47(11):71-74.