基于SSR标记的地方品种糯性小玉米自交系指纹图谱构建
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摘要
利用30对SSR引物检测常熟市糯性鲜食小玉米自交系,有20对引物扩增出多态性特异条带,基于扩增带型清晰、稳定和易于统计及每条染色体上均匀分布原则,从中筛选10对引物作为构建10份糯性小玉米自交系指纹图谱的核心引物。结果表明:10对引物共扩增出39个条带,每对引物检测到条带2～6个,平均为3.9个。相似系数在0.1～0.7。聚类分析表明,10对引物可将10份糯性小玉米自交系区分开来。初步构建了常熟市10个糯性小玉米自交系的指纹图谱。
引文
[1] 赵雅楠,王颖,张东杰,等.基于SSR技术的水稻DNA指纹图谱构建[J].黑龙江八一农垦大学学报,2016,28(5):32-35.
[2] 李青燕,陈向东,董娜,等.利用分子标记建立杂交小麦亲本分子指纹图谱[J].江苏农业科学,2016,44(9):32-34.
[3] 姚丹青,楼坚锋,顾芹芹,等.上海地区玉米品种DNA指纹图谱采集及数据分析[J].上海农业学报,2018,34(4):11-15.
[4] 辛景树.杂交玉米品种DNA指纹图谱[M].北京:中国农业科学技术出版社,2004:196.
[5] 赵久然,王凤格,郭景伦,等.中国玉米新品种DNA指纹库建立系列研究Ⅱ.适于玉米自交系和杂交种指纹图谱绘制的SSR核心引物的确定[J].玉米科学,2003,11(2):3-5.
[6] 黄芸萍,李林章,王迎儿,等.宁波市蔬菜地方种质资源的收集利用及建议[J].中国蔬菜,2018(3):13-15.
[7] 赵军华,吕学高,楼肖成,等.浙江省玉米地方种质表型多样性分析[J].浙江农业科学,2015(5):741-744.
[8] 王庆彪,张扬勇,庄木,等.中国50个甘蓝代表品种EST-SSR指纹图谱的构建[J].中国农业科学,2014,47(1):111-121.
[9] 卢媛,韩晴,王义发,等.糯玉米品种‘沪玉糯3号’种子真实性与纯度鉴定的SSR核心引物筛选[J].上海农业学报,2018,34(3):45-49.
[10] 邸仕忠,孙小红,罗永统,等.重庆市常用及新选玉米自交系SSR指纹图谱构建[J].安徽大学学报(自然科学版),2015,39(5):96-102.
[11] 吕学高,赵军华,卢华兵,等.浙江省玉米地方种质的SSR聚类分析[J].浙江农业科学,2017,58(8):1318-1321.
[12] MATSUOKA Y,VIGOUROUX Y,GOODMAN M M,et al.A single domestication for maize shown by multilocus microsatellite genotyping[J].Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,2002,99(9):6080-6084.
[13] 刘涛,胡萍,赵德刚,等.黔东南地方玉米品种SSR分子标记指纹图谱构建[J].种子,2010,29(9):24-26.
[14] 李世风,步迅,梁水美,等.甘肃部分玉米自交系SSR遗传多样性分析[J].中国农学通报,2016,32(3):91-99.
[2] 李青燕,陈向东,董娜,等.利用分子标记建立杂交小麦亲本分子指纹图谱[J].江苏农业科学,2016,44(9):32-34.
[3] 姚丹青,楼坚锋,顾芹芹,等.上海地区玉米品种DNA指纹图谱采集及数据分析[J].上海农业学报,2018,34(4):11-15.
[4] 辛景树.杂交玉米品种DNA指纹图谱[M].北京:中国农业科学技术出版社,2004:196.
[5] 赵久然,王凤格,郭景伦,等.中国玉米新品种DNA指纹库建立系列研究Ⅱ.适于玉米自交系和杂交种指纹图谱绘制的SSR核心引物的确定[J].玉米科学,2003,11(2):3-5.
[6] 黄芸萍,李林章,王迎儿,等.宁波市蔬菜地方种质资源的收集利用及建议[J].中国蔬菜,2018(3):13-15.
[7] 赵军华,吕学高,楼肖成,等.浙江省玉米地方种质表型多样性分析[J].浙江农业科学,2015(5):741-744.
[8] 王庆彪,张扬勇,庄木,等.中国50个甘蓝代表品种EST-SSR指纹图谱的构建[J].中国农业科学,2014,47(1):111-121.
[9] 卢媛,韩晴,王义发,等.糯玉米品种‘沪玉糯3号’种子真实性与纯度鉴定的SSR核心引物筛选[J].上海农业学报,2018,34(3):45-49.
[10] 邸仕忠,孙小红,罗永统,等.重庆市常用及新选玉米自交系SSR指纹图谱构建[J].安徽大学学报(自然科学版),2015,39(5):96-102.
[11] 吕学高,赵军华,卢华兵,等.浙江省玉米地方种质的SSR聚类分析[J].浙江农业科学,2017,58(8):1318-1321.
[12] MATSUOKA Y,VIGOUROUX Y,GOODMAN M M,et al.A single domestication for maize shown by multilocus microsatellite genotyping[J].Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,2002,99(9):6080-6084.
[13] 刘涛,胡萍,赵德刚,等.黔东南地方玉米品种SSR分子标记指纹图谱构建[J].种子,2010,29(9):24-26.
[14] 李世风,步迅,梁水美,等.甘肃部分玉米自交系SSR遗传多样性分析[J].中国农学通报,2016,32(3):91-99.