胶孢炭疽菌侵染草莓的转录组学研究
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- 论文作者：张丽勍 ; 段可 ; 邹小花 ; 高清华
- 年：2016
- 作者机构：上海市农业科学院;
- 论文关键词：草莓 ; 胶孢炭疽菌 ; 基因转录
- 会议召开时间：2016-08-05
- 会议录名称：中国植物病理学会2016年学术年会论文集
- 英文会议录名称：Proceedings of the Annual Meeting of Chinese Society for Plant Pathology(2016)
- 语种：中文
- 分类号：S436.68
- 学会代码：ZGVS
- 会议名称：中国植物病理学会2016年学术年会
- 会议地点：中国江苏南京
- 主办单位：中国植物病理学会
- 学会名称：中国植物病理学会
- 页数：1
- 文件大小：45k
- 原文格式：O
- 会议级别：全国
摘要
草莓(Fragaria ananasa Duch.)具有非常高的经济价值,为我国传统的优秀果品之一。草莓炭疽病由半活体营养型真菌胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)引起,是我国乃至世界草莓生产上最重要的真菌病害之一,近年来的发生危害有上升趋势。揭示植物与植物病原微生物之间相互作用过程,了解病原微生物致病的分子机制,是提高植物的抗病性和控制植物病害的长期有效的途径。本研究利用High-Seq2000测序平台,对C.gloeosporioides菌丝及其侵染草莓叶片后三个不同时期样品的转录组进行了分析。采用FPKM法计算各基因在不同样本中的差异表达情况,共分析获得差异表达基因4766个。对C.gloeosporioides侵染后3个不同时期之间差异表达基因进行交集和并集分析,结果发现三个时期连续性表达的基因有2 791个,而特异性表达的基因分别为771个,986个和785个。对差异表达基因进行GO和KEGG功能富集,分析结果表明在C.gloeosporioides侵染过程中,碳水化合物代谢、抗氧化通路及水解酶基因等明显富集;PHI(Pathogen-Host Interaction database)注释共得到962个致病相关基因,其中增强致病力的基因8个,致死相关基因71个,丧失致病力基因91个,降低致病力基因342个。运用生物信息学工具对效应子进行了预测,共获得337个候选效应子基因。本研究结果可为深入了解草莓和胶孢炭疽菌共进化的机制,培育广谱、持久抗病的新品种,提供理论基础和技术支持。
引文