鸡Myoz3基因的分子克隆,组织表达分析以及遗传标记筛选
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摘要
(目的)本次研究旨在对鸡Myoz3基因的开放阅读框进行克隆,对时空表达特征进行分析,并对遗传标记进行筛选。(方法)我们利用直接扩增的方式克隆Myoz3基因的开放阅读框(ORF)。利用RT-qPCR分析Myoz3基因mRNA在矮脚黄鸡以及艾维茵肉鸡两个品种中的时空表达规律,通过直接测序的方法分析Myoz3基因在不同品种中的多态性,并根据多态性位点筛选出适合的分子标记辅助育种。(结果)在本次研究中我们发现,Myoz3蛋白的分子质量大约为26ku,序列和火鸡Myoz3蛋白具有97%的相似性,并与野鸭有76%的相似性。Myoz3在胸肌和腿肌中表达量较高,而在心脏和肝脏中表达量较低(P<0.05),同时性别1个影响Myoz3表达量的重要因素,Myoz3的表达在不同性别之间展现出了不同的时间表达变化趋势(P<0.05)。之后,我们使用了直接测序的方法鉴定了Myoz3基因的多态性,并在矮脚黄鸡种发现了5个SNP位点,而在艾维茵中发现了3个。通过分析这些SNP位点对应的基因型和生产性状之间的关系,我们发现,c.516C>T位点对生产性状有影响,拥有基因型AA的个体在胫骨长度以及胸肌的亮度(L~*)上具有明显优势(P<0.05)。我们又根据这些SNP的连锁关系构建了单倍体基因型以及双倍体基因型,并发现具有双倍体基因型H1H3的个体有最长的胫骨围。(结论)在本次研究中鉴定的分子标记可以为育种工作提供帮助。
引文

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