草菇超氧化物歧化酶家族基因的组成、结构及其表达的特殊性
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- 论文作者：严俊杰 ; 王瑞清 ; 谢斌 ; 张磊 ; 李肖 ; 谢宝贵
- 年：2016
- 作者机构：福建农林大学生命科学学院菌物研究中心;福建农林大学食品科学学院;
- 论文关键词：草菇 ; 超氧化物歧化酶 ; 可变剪接 ; 低温应答 ; 子实体发育 ; 差异表达
- 会议召开时间：2016-08-19
- 会议录名称：中国菌物学会2016年学术年会论文摘要集
- 英文会议录名称：Abstracts of 2016 Mycological Society of China Annual Meeting
- 语种：中文
- 分类号：S646.13
- 学会代码：ZGVL
- 会议名称：中国菌物学会2016年学术年会
- 会议地点：中国福建福州
- 主办单位：中国菌物学会
- 学会名称：中国菌物学会
- 页数：1
- 文件大小：665k
- 原文格式：D
- 会议级别：全国
摘要
超氧化物歧化酶是细胞防御活性氧毒害作用的第一道防线,在生物体应答胁迫、抵抗衰老以及细胞分化等过程中起到十分重要的作用。本研究基于草菇基因组测序结果注释获得1个Cu-Zn SOD编码基因和2个Mn SOD编码基因。亚细胞定位结果表明:Vv_Mn SOD1定位于细胞质中,Vv_Mn SOD2定位于线粒体中;信号肽的预测结果显示:Vv_Cu-Zn SOD1含有一段17aa的信号肽序列,属于extracellular Cu-Zn SOD(ec Cu-Zn SOD)。转录组reads定位结果显示:3个Vv_sod基因均存在复杂的可变剪接方式,有可能是草菇出现多个SOD同工酶的主要原因;其中,Vv_Cu-Znsod1起始密码子位于第4个内含子(I4)上,只有在I4保留时该序列才可翻译成有SOD功能域的蛋白序列。荧光定量PCR的结果显示:Vv_Cu-Znsod1及Vv_Mnsod2在子实体不同发育阶段表现出共表达模式并在蛋形期菌盖表达量最高,这与担子中核配的发生速率一致,推测这两个基因的高表达可能与核配的发生相关;低温胁迫可诱导草菇3个sod基因显著上调表达,说明草菇的3个sod基因均参与了低温应答过程。本研究发现草菇含有一个的ec Cu-Zn SOD,但未发现intracellular Cu-Zn SOD(ic Cu-Zn SOD),这是首次在担子菌中发现的ec Cu-Zn SOD,该发现意味着草菇的抗氧化系统与其他真菌存在较大差异;草菇缺少ic Cu-Zn SOD,而ec Cu-Zn SOD基因仅在I4保留时才可发挥正常功能,可能是导致草菇不耐低温的原因之一。
引文
Yan JJ,Zhang L,Wang RQ,Xie B,Li X,Chen RL,Guo LX,Xie BG,2016.The Sequence Characteristics and Expression Models Reveal Superoxide Dismutase Involved in Cold Response and Fruiting Body Development in Volvariella volvacea.International Journal of Molecular Sciences,17(1):34.