SSR标记与陆地棉黄萎病抗性的关联分析
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摘要
选取203份遗传背景差异较大的陆地棉种质在河北省农林科学院棉花研究所小安舍试验站黄萎病病圃进行了3年(2013—2015年)黄萎病抗性重复鉴定。选用在棉花基因组上均匀分布多态性较好245个SSR标记对供试群体进行全基因组扫描,获得290个多态性位点,共计704个等位变异。利用Structure软件对群体进行结构分析,采用Tassel软件中GLM(Q)方法将供试群体3年的黄萎病病情指数和SSR标记位点进行关联分析。结果表明:关联群体不同种质间黄萎病发病情况差异显著。按照基因型数据可将关联群体划分为2个亚群。通过关联分析,在不同年份中发掘与黄萎病抗性显著关联(P<0.01)的SSR位点27个,其中有2个位点(BNL3442和BNL1064)在3年均重复检测到,解释表型变异率最高分别为12.10%和8.02%。3个位点(Gh433、NAU3607和JESPR153)在2013年和2014年同时检测到与黄萎病抗性显著关联,6个位点(BNL3902、NAU5428、BNL1646-1、BNL1646-2、CGR5996和HAU1774)在2014年和2015年同时检测到与黄萎病抗性显著关联,其余16个位点仅在1个年份检测到与黄萎病抗性相关联。这些在不同年份中稳定存在的SSR标记位点有可能与抗病基因紧密连锁,有望用于棉花黄萎病抗性材料筛选和抗病基因挖掘中。此外,筛选抗病品系4个,挖掘携带优异等位变异的典型材料2份,为陆地棉抗病育种和种质创新提供有益信息。
引文

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