人巨细胞病毒临床病毒株UL136基因B细胞表位的预测与分析
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- 论文作者：郭梦杰 ; 伍苑宾 ; 胡兢晶 ; 苏海浩 ; 蔡丽君 ; 密英鸽 ; 王波
- 年：2014
- 作者机构：广东省儿童医院·广东省妇幼保健院儿科;
- 论文关键词：人巨细胞病毒 ; UL36 ; B细胞表位
- 会议召开时间：2014-12-19
- 会议录名称：广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会论文及摘要汇编
- 英文会议录名称：Theses and Abstracts Compilation of 9th Conference on Genetics,Guangdong
- 语种：中文
- 分类号：R373
- 学会代码：GDKL
- 会议名称：广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会
- 会议地点：中国广东广州
- 主办单位：广东省遗传学会
- 学会名称：广东省科学技术协会科技交流部
- 页数：1
- 文件大小：42k
- 原文格式：O
- 会议级别：地方
摘要
目的:预测与分析人巨细胞病毒(HCMV)临床病毒株UL136基因B细胞表位。方法:应用生物信息学方法,以HCMV UL136基因氨基酸序列为基础,采用改进型自我优化预测结构(SOPMA),Garnier-Osguthorpe-Robson(GOR),人工神经网络预测法(HNN)预测二级结构,结合跨膜结构、Hopp&Woods亲水性方案、Emini可及性方案、Jameson-Wolf抗原性方案等参数综合预测UL136基因B细胞表位。结果:HCMV pUL136氨基酸包含240个氨基酸残基,相对分子质量约为27.3kD,等电点为7.54-8.51,应用SOPMA、GOR、HNN方案预测pUL136二级结构,均显示以α-螺旋为主,无规则卷及β-转角区域多位于6-18、38-61、108-1 13、129-139、141-143、147-161、163-182、189-203。TMHMM预测pUL136存在一个跨膜区域,为65-87位氨基酸,胞外区域为88-240位氨基酸。结论:HCMV UL136基因196-202,128-144,110-1 16位氨基酸序列区域内或其附近主要以无规则卷或β-转角结构为主,且抗原指数(AI)较高,极有可能是B细胞表位。
引文