结核病患者外周血γδT细胞的免疫组库特征
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摘要
目的:γδT细胞在结核杆菌感染的最早期活化,在机体对抗结核杆菌感染的免疫应答中发挥重要作用。本研究通过对健康人和结核病(TB)患者外周血γδT细胞的抗原互补决定区(CDR)3序列进行高通量分析,获得与结核杆菌感染相关的γδT细胞CDR3的免疫组库特征,为深入阐明γδT细胞抗结核杆菌感染的作用机制提供理论基础。方法:收集健康人和TB患者外周血,经密度梯度离心法获得外周淋巴细胞(PBMC),利用多重PCR及高通量免疫组库测序技术,分析γ链(TRG)和δ链(TRD)的CDR3免疫组库特征。结果:收集患者38例(男27例,女11例;年龄48.6±18),选取其中结核杆菌培养阳性病例12例(男:女=5:1,年龄33.4±13);健康人14例(男6例,女8例;年龄48.6±13)。测序数据每个样品平均测到的CDR3数量为1671553,平均CDR3种类为4601条。CDR3多样性分析显示TB患者TRG和TRD的diversity数值,较健康对照都有显著下降(P<0.05);D50数值仅在γ链上TB患者组较健康对照组都有显著下降(P<0.05);γδT细胞δ链VJ基因片段的取用频率分析显示TB患者TRDV3和TRDJ4基因片段的取用要显著低于健康对照(P<0.05),另外我们对TB患者γδT细胞CDR3区优势序列大小及分布、长度多态性分布、随机插入(N-insert)和消减(V-trim、J-trim)的长度多态性分布等特征进行分析,均没有发现与健康对照存在明显差异。结论:结核杆菌感染影响了外周血γδT细胞免疫组库特征的变化,主要表现为部分CDR3克隆发生了感染相关的扩增导致免疫组库的多样性变小,为我们利用感染特异性扩增的CDR3序列筛选γδT细胞识别的相关抗原奠定了基础。
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