根肿菌侵染拟南芥根部的代谢变化研究
详细信息 查看官网全文
- 论文作者：何璋超 ; 陈桃 ; 毕凯 ; 高知枭 ; 赵莹 ; 姜道宏
- 年：2016
- 作者机构：湖北省作物病害监测和安全控制重点实验室(华中农业大学);农业微生物学国家重点实验室(华中农业大学);
- 论文关键词：芸薹根肿菌 ; 拟南芥 ; 代谢组
- 会议召开时间：2016-08-05
- 会议录名称：中国植物病理学会2016年学术年会论文集
- 英文会议录名称：Proceedings of the Annual Meeting of Chinese Society for Plant Pathology(2016)
- 语种：中文
- 分类号：S432.4
- 学会代码：ZGVS
- 会议名称：中国植物病理学会2016年学术年会
- 会议地点：中国江苏南京
- 主办单位：中国植物病理学会
- 学会名称：中国植物病理学会
- 页数：1
- 文件大小：53k
- 原文格式：O
- 会议级别：全国
摘要
芸薹根肿菌(Plasmodiophora brassicae)属于原生动物界、根肿菌门,是一种活体专性寄生的土传病原菌,可以为害100多种十字花科植物,引起寄主根部肿大。本研究利用基于UPLC-MS的代谢组学分析技术探索拟南芥受根肿菌侵染时根部代谢物的动态变化,通过PCA、PLS、O-PLS和SVM等多变量模式识别方法,结合相关数据库信息,以期筛选到重要的生物标记物和代谢通路。本研究通过油菜根部肿块进行组织培养获得大量含有根肿菌的愈伤组织,采用1/2 MS培养基培养拟南芥Col-0,接种根肿菌后,在根毛吸附的侵染早期、根毛侵染期、皮层侵染期等不同时期采取拟南芥根部样品,提取代谢物后进行质谱分析。目前已得到接种50d后的侵染后期拟南芥根部代谢组数据,运用R version 3.2.3xcms程序对质谱原始数据进行预处理,共得到39 428个峰,先用T-statistics单变量分析方法,设置变化倍数fold>4,p value<0.05,筛选出2736个峰。运用R CAMERA对xcms处理后的数据进行进一步注释,识别加合物峰、同位素峰、碎片峰等,剔除掉同一代谢物的其他形式的峰后,用SIMCA-P+11.0软件进行PLS-DA多变量统计分析,结果显示接种根肿菌后的处理组同对照组具有很好的分离趋势,说明接种根肿菌后拟南芥代谢发生了显著变化。综合运用CAMERA处理结果、Metaboanalyst代谢组学分析平台、Mummichog软件进行代谢物的鉴定和代谢通路富集分析,分析结果显示色氨酸代谢、赖氨酸代谢、不饱和脂肪酸β氧化、多聚不饱和脂肪酸生物合成等通路得到显著富集。
引文