小麦叶锈菌FHPL在TcLr19及其感病突变体上的差异表达分析
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摘要
小麦叶锈菌对不同寄主致病性差异的研究对揭示其致病的分子机制有重要意义。本实验采用对野生型小麦TcLr19和其突变体小麦MuLr19分别表现侵染型为0和3的小麦叶锈菌FHPL分别接种TcLr19和MuLr19,通过分析其在不同寄主上的表达差异,以期揭示小麦叶锈菌FHPL的致病相关基因。我们分别提取未接菌TcLr19/MuLr19、接种叶锈菌FHPL 24h和6d后的总RNA,进行denove测序,拼接得到总转录组,扣除寄主小麦的转录组后,得到叶锈菌FHPL的Unigenes总数32 168个。对基因表达水平和差异表达进行分析,结果接种24h和6d后FHPL在TcLr19和MuLr19上差异表达基因分别有127个和179个,其中,24h和6d共同差异表达的基因50个。Gene Ontology注释成功的59个,其中,生物过程46个,分子功能19个,细胞组分35个。KEGG Pathway显著性富集分析中,接种24h后PtM_24h相对于Pt19_24h显著富集,苯丙素生物合成及苯丙氨酸代谢基因c66749_g3(苯丙氨酸氨裂解酶)下调、RNA降解及真核生物核糖体生物合成和氧化磷酸化途径中基因c14572_g1 XRN2、RAT1下调、氧化磷酸化途径中基因c59559_g1(H~+转运ATP激酶)下调;接种6d后PtM_相对于Pt19_基因c36028_g1下调(硫胺代谢)、脂肪酸代谢中基因c38476_g1、c71646_g1、c32016_g1(醛脱氢酶)c60322_g3、c60322_g1(adhP)下调、戊糖和葡萄糖醛糖相互转换途径中醛脱氢酶相关基因c38476_g1、c71646_g1、c32016_g1,c13955_g1 AKR1A1,adh下调、组氨酸代谢中醛脱氢酶基因c38476_g1、c71646_g1、c32016_g1下调、糖酵解途径中醛脱氢酶基因(c32016_g1、c38476_g1、c71646_g1),c13955_g1(AKR1A1,adh)c60322_g3、c60322_g1(adhP)下调、细胞色素P450途径中基因c60322_g3、c60322_g1(adhP)下调、玉米素生物合成途径中基因c47978_g1(CKX)下调。研究为进一步深入开展差异表达的基因的功能分析,明确其在致病中的作用奠定了基础。
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