通过RNA-Seq解析南方水稻矮缩病毒侵染介体昆虫培养细胞后不同时间的转录水平变化
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- 论文作者：吴维 ; 江朝阳 ; 韩玉 ; 陈红燕 ; 贾东升 ; 王海峰 ; 魏太云
- 年：2016
- 作者机构：福建农林大学植物病毒研究所福建省植物病毒学重点实验室;福建农林大学植物保护学院;
- 论文关键词：南方水稻黑条矮缩病毒 ; 培养细胞 ; 白背飞虱 ; 转录组
- 会议召开时间：2016-08-05
- 会议录名称：中国植物病理学会2016年学术年会论文集
- 英文会议录名称：Proceedings of the Annual Meeting of Chinese Society for Plant Pathology(2016)
- 语种：中文
- 分类号：S435.11
- 学会代码：ZGVS
- 会议名称：中国植物病理学会2016年学术年会
- 会议地点：中国江苏南京
- 主办单位：中国植物病理学会
- 学会名称：中国植物病理学会
- 页数：1
- 文件大小：57k
- 原文格式：O
- 会议级别：全国
摘要
南方水稻黑条矮缩病毒(Southern rice black-streaked dwarf virus,SRBSDV)由介体白背飞虱(Sogatella furcifera,Horvath)以持久增殖型方式传播,其引起的南方水稻黑条矮缩病是水稻生产上一种重要的病毒病害。为了研究SRBSDV侵染介体昆虫后,介体响应病毒侵染以及SRBSDV的复制增殖机理,我们根据病毒侵染不同阶段利用Illumina平台测定了SRBSDV在白背飞虱培养细胞中初侵染(2 h)、复制增殖(48 h)、以及病毒完全侵染时(120h)的转录组。对转录组测序结果进行组装后共得到70 712条Unigene序列,通过GO聚类和KEGG Pathway代谢通路分析发现与生物代谢相关的基因最多。在对四组样品进行差异分析后,共得到1485个显著差异表达基因,其中病毒侵染后2,48,120h的上调表达基因分别为306、323和359个,下调表达基因分别为428、370和486个。对差异基因进行GO和KEGG聚类分析后结果表明:介体昆虫培养细胞对SRBSDV侵染不同时间的响应存在差异,在病毒通过内吞侵入时,会导致培养细胞的细胞膜发生一系列的改变,此时差异基因主要集中在细胞过程相关通路,如细胞连接、膜相关蛋白、吞噬等;在病毒大量复制时,其需要借助细胞内各种原料,导致与代谢相关通路基因大量上调;当病毒在细胞内大量积累时,会导致细胞的死亡,此时与细胞程序性死亡相关通路基因大量上调表达,且免疫通路相关基因在病毒侵染后期表达最高,初侵染时次之,病毒在单个细胞中复制时最低,表明病毒侵染不同时期的介体培养细胞对病毒亲和性存在差异,病毒初侵染引起免疫通路相关基因的差异表达要高于在单个细胞中复制时的差异表达,且SRBSDV的侵染对白背飞虱培养细胞是有害的,病毒的大量积累会导致细胞死亡。
引文