小麦黄花叶病毒(WYMV)两个山东分离物的全基因组序列及进化分析
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- 论文作者：耿国伟 ; 于成明 ; 王德亚 ; 顾珂 ; 李向东 ; 原雪峰
- 年：2016
- 作者机构：山东农业大学植物保护学院植物病理系山东省农业微生物重点实验室;
- 论文关键词：小麦黄花叶病毒 ; 系统发生树 ; RNA重组 ; 进化
- 会议召开时间：2016-08-05
- 会议录名称：中国植物病理学会2016年学术年会论文集
- 英文会议录名称：Proceedings of the Annual Meeting of Chinese Society for Plant Pathology(2016)
- 语种：中文
- 分类号：S435.121.4
- 学会代码：ZGVS
- 会议名称：中国植物病理学会2016年学术年会
- 会议地点：中国江苏南京
- 主办单位：中国植物病理学会
- 学会名称：中国植物病理学会
- 页数：1
- 文件大小：55k
- 原文格式：O
- 会议级别：全国
摘要
小麦黄花叶病毒(Wheat yellow mosaic virus,WYMV)是小麦黄花叶病的主要病原之一,在我国分布广泛,对小麦生长、发育构成严重危害。WYMV粒子呈弯曲线状,长度分为300nm和600nm两种。WYMV为二分体基因组,由两条线性的单链正义RNA组成。RNA 1全长约7.6kb,RNA 2全长约3.6kb,分别编码一个270kDa和100kDa的多聚蛋白。WYMV RNA的5′端有共价结合的VPg,3′端有一个poly(A)尾。利用5′RACE结合一步法RT-PCR分别从山东泰安与临沂冬小麦上克隆了WYMV的全基因组序列(TADWK和LYJN)。这两个分离物基因组间核苷酸一致性分别为97.21%(RNA1)和95.12%(RNA2)。通过对目前已报道的共14个WYMV分离物的基因组不同部分的分析,表明5′UTR是WYMV基因组变化幅度最大的区域,而编码区(ORF)及3′UTR的序列一致性较高且变动幅度小。另外,发现LYJN RNA2的5′UTR与已报道的所有分离物RNA2的核苷酸一致率仅为90%左右。综合分析RNA1和RNA2的系统发生树,表明WYMV各基因组片段呈单独进化特征,不同分离物间存在RNA重排。RNA重组分析显示在LYJN RNA1和TADWK RNA2发现了RNA重组。此研究说明WYMV在山东地区存在分离物分化现象,并且表明WYMV的5′UTR是基因组中的突变热点。5′UTR的高频率突变可能导致潜在的IRES(核糖体内部进入位点)活性变化,从而导致WYMV不同分离物的蛋白表达差异并影响致病力。从山东临沂的4个小麦品种(LM4、AK58、TS23、LY502)克隆的WYMV为同一分离物,序列同源性大于99%;但是就其田间发病情况来看LM4、AK58、TS23这3个品种较之LY502要严重的多,并且LY502要比其他3个品种发病晚。不同小麦品种对WYMV的抗病性差异可能与翻译起始因子(eIF4E)的变异有关。
引文