氧化锆硅胶复合整体柱在线固相萃取-质谱分析用于修饰核苷的分析
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摘要
RNA中存在广泛的修饰核苷,目前已被鉴定出来的有至少140种~1。在生物体液中测定内源性的修饰核苷可用作为疾病诊断的策略~2。但是由于这些修饰核苷的含量很低并且生物体液中基质复杂,修饰核苷的检测仍然是一个很大的挑战。基于此,我们制备了氧化锆硅胶复合整体柱,用于检测顺式二羟基化合物。相比于传统的硼亲和材料整体柱,氧化锆硅胶复合整体柱对顺式二羟基化合物同样有很好的萃取效果,并且吸附容量要大2到3个数量级,萃取时的pH在中性,有着更好的生物相容性。所以我们建立了在线固相萃取结合质谱检测方法,综合分析了正常人类尿液和癌症病人尿液中的RNA修饰核苷。在尿液中总共发现了68种修饰核苷,其中有4种修饰核苷是首次在人的尿液中发现。定量的数据显示在胃癌,食管癌和淋巴瘤的病人尿液中有16、11、7种修饰核苷含量有着显著升高。这些显著升高的化合物可能在癌变过程中起到了很重要的作用,并且可能在早期癌症的诊断中作为肿瘤标记物
Determination of endogenous modified nucleosides in biological fluids may serve as non-invasive disease diagnostic strategy.Here,we developed a facile preparation strategy and successfully synthesized zirconium oxide-silica(ZrO_2/SiO_2) composite capillary monolithic column and established an online solid-phase microextraction(SPME) in combination with liquid chromatography-mass spectrometry(online SPME-LC-MS/MS) analysis for the comprehensive profiling nucleosides modification in human urine.
引文
[1]Machnicka,M.A.;Milanowska,K.;Osman Oglou,O.;Purta,E.;Kurkowska,M.;Olchowik,A.;Januszewski,W.;Kalinowski,S.;Dunin-Horkawicz,S.;Rother,K.M.;Helm,M.;Bujnicki,J.M.;Grosjean,H.,Nucleic Acids Res.2013,41:D262.
    [2]Seidel,A.;Brunner,S.;Seidel,P.;Fritz,G.I.;Herbarth,O.,Brit.J.Cancer 2006,94:1726

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