三种石蕊属地衣的内生真菌及内生细菌

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• 论文作者：郭守玉
• 年：2016
• 作者机构：中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室;
• 论文关键词：大兴安岭 ; 石蕊属 ; 内生真菌 ; 内生细菌 ; 高通量测序 ; 16s-V4 ; ITS2
• 会议召开时间：2016-08-19
• 会议录名称：中国菌物学会2016年学术年会论文摘要集
• 英文会议录名称：Abstracts of 2016 Mycological Society of China Annual Meeting
• 语种：中文
• 分类号：Q949.34
• 学会代码：ZGVL
• 会议名称：中国菌物学会2016年学术年会
• 会议地点：中国福建福州
• 主办单位：中国菌物学会
• 学会名称：中国菌物学会
• 页数：1
• 文件大小：631k
• 原文格式：D
• 会议级别：全国

摘要

地衣是真菌与藻类或蓝细菌互惠共生的生命支撑系统及微型生态系统,其体内不仅存在占主导地位的真菌生物体(mycobiont)及光合生物体(photobiont),还存在种类丰富的内生真菌及内生细菌。采用Illumina Mi Seq/Hi Seq测序平台对采自大兴安岭地区的生长在一起的3种石蕊属地衣(雀石蕊Cladonia stellaris,石蕊Cl.rangiferina,及黑穗石蕊Cl.amaurocraea)的内生细菌16S-V4区及内生真菌真菌ITS1区和ITS2区分别进行测序和分析。基于有效数据(Clean Data)进行OTUs聚类和物种分类分析,得到每个样品的OTUs和物种注释的结果。分析中97%一致性阈值水平下聚类成为一个OTU的序列通常被认为可能是源自于同一个种(Species Boundary)的序列。在内生真菌的分析中,ITS2区的结果优于ITS1区的结果,从3种地衣中共获得63个内生真菌OTUs,主要属于担子菌门的伞菌纲伞菌目和子囊菌门锤舌菌纲斑痣盘菌目;3种地衣的内生真菌OTUs总数及特有的OTUs数目分别为雀石蕊(33,8),石蕊(33,6)及黑穗石蕊(41,18)。内生细菌分析显示,从3种地衣中共获得483个内生细菌OTUs,主要属于蓝细菌门(Cyanobacteria)和变形菌门(Proteobacteria)的种类,其次为酸杆菌门(Acidobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes),而放线菌门(Actinobacteria)的种类均非常稀少;3种地衣所含内生细菌OTUs总数及特有的OTUs数目分别为雀石蕊(335,27),石蕊(375,49)及黑穗石蕊(347,44)。

引文

Mushegian AA,Peterson CN,Baker CCM and Pringle A.2011.Bacterial Diversity across Individual Lichens.Applied and Environmental Microbiology 77(12):4249-4252.
    Bates ST,Berg-Lyons D,Lauber CL,Walters WA,Knight R and Fierer N.2012.A preliminary survey of lichen associated eukaryotes using pyrosequencing.The Lichenologist 44(1):137-146.