柑橘抗/感溃疡病品种中内生细菌多样性分析
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摘要
溃疡病是柑橘上的一种检疫性病害,对柑橘生产造成严重影响。该病对柑橘品种的选择性很强,以甜橙类受害最为严重。前期试验中发现柑橘抗病品种中的可培养内生细菌相对于感病品种来说种类少、数量多、强颉颃菌株比重大。为进一步探索柑橘内生细菌在寄主品种抗溃疡病中的作用,本研究分别提取温州蜜柑(抗溃疡病品种)和纽荷尔脐橙(感溃疡病品种)叶片与果实的基因组DNA,进行16s rDNA V4高变区扩增后建库测序,将所有样品的Effective Tags聚类为OTUs并注释。分析结果表明,样品的主要细菌类群为泛菌属(Pantoea),盐单胞菌属(Halomonas),假单胞菌属(Pseudomonas),藤黄单胞菌属(Luteimonas),拟杆菌属(Bacteroides)以及不动杆菌属(Acinetobacter)等。其中温州蜜柑叶片和果实中比例最大的细菌类群均为盐单胞菌属(Halomonas),但果实中细菌类群更多样化;纽荷尔脐橙叶片中最多的细菌类群也为盐单胞菌属(Halomonas),但要比温州蜜柑叶片中的比例小,而果实中存在盐单胞菌属(Halomonas)比例较小,其他细菌类群丰富且比例均匀,泛菌属(Pantoea)比例稍大。4个样品中内生细菌物种丰富程度依次为:纽荷尔脐橙果实>温州蜜柑果实>纽荷尔脐橙叶片>温州蜜柑叶片。由此可见,温州蜜柑和纽荷尔脐橙叶片、果实中的内生菌菌群存在明显差异但又有共同之处,结合前期试验结果和柑橘品种发病程度,推测柑橘内生细菌可能与寄主抗病能力之间有一定关系,确切关系还需要进一步的深入分析和试验验证。
引文