非极性氨基酸对y_2离子气相结构与质子亲和力影响的研究
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摘要
串联质谱技术是分析蛋白和多肽的重要手段。在碰撞诱导解离(CID)的模式下,肽段发生碎裂产生系列a,b,y离子,可实现肽段的测序。然而,质谱图除了给出质荷比的信息外,离子峰峰强也揭示了气相中碎裂的机理[1]。利用ESI-Q-TOF质谱联用技术,我们研究了质子化模型肽LAXA(X=G,A,V,L,I,F)的碎裂。在相同的实验条件下,通过对每一条模型肽的y_2,b_2离子丰度进行测量并计算丰度比值I_(y2)/I_(b2),发现随着残基X的侧链碳个数的增加,I_(y2)/I_(b2)逐渐升高。报道显示,Lys及其类似物随侧链长度的缩短,其质子亲和力降低[2]。因此,我们认为:I_(y2)/I_(b2)的不同源于y_2质子亲和力不同。为验证此假设,我们在B3LYP/6-31G+(d,p)水平优化了系列y_2的结构,并计算了y_2的质子亲和力(图1)。研究结果显示:随着非极性XA(X=G,A,V,L,I,F)的侧链碳个数的增加,y_2的质子亲和力逐渐升高,而母离子发生碎裂产生相同结构的b_2离子,因此I_(y2)/I_(b2)逐渐升高。
Protonated model peptides LAXA(X=G,A,V,L,I,F) were investigated under a same experimental conditions under CID in ESI-Q-TOF tandem mass spectrometry.With the increase of nonpolar residue side chain carbon number,the peak intensity ratios of I_(y2)/I_(b2)(In(XA/LA)) were increased.DFT calculations at B3LYP/6-31G+(d,p)level indicated that the tendency of I_(y2)/I_(b2) was consistent with proton affinities of the XA ions.
引文
[1]Li,W.;Ji,L.;Goya,J.;Tan,G.;Wysocki,V.H.J.Proteome Res.2011,10(4):1593.
    [2]Schroeder,O.E.;Andriole,E.J.;Carver,K.L.;Colyer,K.E.;Poutsma,J.C.J.Phys.Chem.A.2004,108(2):326.

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