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1.Neuropathology and neurobehavioral alterations in a rat model of traumatic brain injury to occupants of vehicles targeted by underbody blasts

作者：Flaubert Tchantchou^a ; ^{ftchantchou@anes.umm.edu} ; William L. Fourney^b ; ^four@umd.edu ; Ulrich H. Leiste^b ; ^{uleiste@umd.edu} ; Joshua Vaughan^a ; ^{vaughan1009@gmail.com} ; Parisa Rangghran^a ; ^{prangghran@anes.umm.edu} ; Adam Puche^c ; ^{apuche@umaryland.edu} ; Gary Fiskum^a ; ^{gfiskum@anes.umm.edu}

关键词：Acceleration ; Apoptosis ; Inflammation ; Anxiety ; Synapse

刊名：Experimental Neurology

出版年：2017

2.Glucosylceramide transferase in Giardia preferentially catalyzes the synthesis of galactosylceramide during encystation

作者：Leobarda Robles-Martinez^a ; ^b ; ¹ ; ² ; Tavis L. Mendez^a ; ^b ; ¹ ; ² ; Jennifer Apodaca^a ; ^b ; Siddhartha Das^a ; ^b ; ^{sdas@utep.edu}

关键词：BLAST ; basic local alignment search tool ; CGlcT ; ceramide glucosyltransferase ; CGalT ; ceramide galactosyltransferase ; ESV ; encystation-specific vesicles ; gGlcT1 ; giardial glucosylceramide transferase 1 ; GlcCer ; glucosylceramide GalCer galactosylceramide ; GDP ; guanosine diphosphate ; GSL ; glycosphingolipid ; HMM ; hidden Markov model ; h.p.i.e ; hours post-induction of encystation ; KD ; knockdown ; NBD-ceramide ; N-[7-(4-nitrobenzo-2-oxa-1 3-diazole)]-ceramide ; PDI-2 ; protein-disulfide isomerase-2 ; TLC

刊名：Molecular and Biochemical Parasitology

出版年：2017

3.Homology modeling and molecular dynamics simulation of the HIF2α degradation-related HIF2α-VHL complex

作者：Xiaotian Dong^a ; ¹ ; ^{xiaotiandong@zju.edu.cn} ; Xiaoru Su^b ; ¹ ; ^{sxr1240@163.com} ; Jiong Yu^a ; ^{yujiong@zju.edu.cn} ; Jingqi Liu^a ; ^{jqliu97@zju.edu.cn} ; Xiaowei Shi^c ; ^{sxwschy@163.com} ; Qiaoling Pan^a ; ^{qiaolingpan@zju.edu.cn} ; Jinfeng Yang^a ; ^{jinfengjinfengyang@163.com} ; Jiajia Chen^a ; ^{jiajiatale@163.com} ; Lanjuan Li^a ; ^{ljli@zju.edu.cn} ; Hongcui Cao^a ; ^{hccao@zju.edu.cn} ; ^{zjucaohc@163.com}

关键词：HIF2α ; hypoxia-inducible factor 2α ; VHL ; Von Hippel&ndash ; Lindau ; pVHL ; von Hippel Lindau tumor suppressor protein ; CODD ; C-terminal oxygen-dependent degradation domain ; 3D ; three-dimensional ; ARNT ; aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator ; HRE ; hypoxia response element ; EPO ; erythropoietin ; VEGF ; vascular endothelial growth factor ; GLUT1 ; glucose transporter 1 ; EDN1 ; endothelin 1 ; TFDP3 ; transcription factor DP family member 3 ; NMR ; nuclear magnetic resonance ; Blastp ; protein&ndash ; protei

刊名：Journal of Molecular Graphics and Modelling

出版年：2017

4.Comparative analysis of the neurula transcriptomes of two species of flatfishes: Platichthys stellatus and Paralichthys olivaceus

作者：Fen Wei ; Jie Chen ; Xinye Chen ; Baolong Bao ; ^{blbao@shou.edu.cn" class="auth_mail" title="E-mail the corresponding author}

关键词：BMP ; Bone Morphogenetic Protein ; BMPR ; Bone Morphogenetic Protein Receptor ; BLAST ; Basic Local Alignment Search Tool ; ERBB ; Erb-b2 Receptor Tyrosine Kinase ; FGF ; Fibroblast Growth Factor ; FGFR ; Fibroblast Growth Factor Receptor ; FZ ; Frizzled ; HOXB1B ; Homeobox B 1b ; KEGG ; Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome ; KAAS ; KEGG Automatic Annotation Server ; KOG ; Eukaryotic Orthologous Groups ; LHX2 ; LIM Homeobox 2 ; MAPK ; Mitogen-activated Protein Kinase ; mRNA ; Messenger RNA ; NCBI ; National Center for Bio

刊名：Gene

出版年：2017

5.A Tissue-Mapped Axolotl De Novo Transcriptome Enables Identification of Limb Regeneration Factors

作者：Donald M. Bryant¹ ; ⁶ ; Kimberly Johnson¹ ; ⁶ ; Tia DiTommaso¹ ; Timothy Tickle² ; Matthew Brian Couger³ ; Duygu Payzin-Dogru¹ ; Tae J. Lee¹ ; Nicholas D. Leigh¹ ; Tzu-Hsing Kuo¹ ; Francis G. Davis¹ ; Joel Bateman¹ ; Sevara Bryant¹ ; Anna R. Guzikowski¹ ; Stephanie L. Tsai⁴ ; Steven Coyne¹ ; William W. Ye¹ ; Robert M. Freeman Jr.⁵ ; Leonid Peshkin⁵ ; Clifford J. Tabin⁴ ; Aviv Regev² ; Brian J. Haas² ; ^{bhaas@broadinstitute.org} ; Jessica L. Whited¹ ; ⁷ ; ^{jwhited@bwh.harvard.edu}

关键词：axolotl ; transcriptome ; Trinity ; Trinotate ; limb ; regeneration ; blastema ; expression analysis ; cirbp ; kazald1

刊名：Cell Reports

出版年：2017

6.Transcriptomic profile of Manila clam (Ruditapes philippinarum) haemocytes in response to Perkinsus olseni infection

作者：Abul Farah Md. Hasanuzzaman^a ; ^b ; ^{mhzaman.bd@gmail.com} ; Diego Robledo^c ; ^{diego.robledo@usc.es} ; Antonio Gó ; mez-Tato^d ; ^{antonio.gomez.tato@usc.es} ; Jose A. Alvarez Dios^e ; ^{joseantonio.alvarez.dios@usc.es} ; Peter W. Harrison^f ; ^{p.w.harrison@ucl.ac.uk} ; Asunció ; n Cao^g ; ^{asun@cimacoron.org} ; Sergio Ferná ; ndez-Boo^g ; ^{fernandezboo.sergio@gmail.com} ; Antonio Villalba^g ; ^h ; ^{antonio.villalba.garcia@xunta.es} ; Belé ; n G. Pardo^a ; ^{belen.gomez@usc.es} ; Paulino Martí ; nez^a ; ^{paulino.martinez@usc.es}

关键词：AIP ; Apoptosis Inhibitor Protein ; BIRC ; Baculoviral Iap Repeat-Containing protein ; Bp ; base pair ; BP ; Biological Process ; CC ; Cellular Component ; DEGs ; Differentially Expressed Genes ; ECP ; Extracellular Product ; FC ; Fold Change ; FDR ; False Discovery Rate ; FPKM ; Fragments Per Kilobase of transcript per Million mapped reads ; FSW ; Filtered Sea Water ; GO ; Gene Ontology ; HSP ; Heat Shock Proteins ; IVT ; in vitro ; IVVI ; in vivo indoor ; IVVN ; in vivo natural ; MF ; Molecular Function ; PE ; Paired-End ; RNA-s

刊名：Aquaculture

出版年：2017

7.Development of a rapid, one-step screening method for the isolation of presumptive proteolytic enterococci

作者：Ken Graham^a ; ^b ; ^{ken.graham@mycit.ie} ; Rosemary Rea^a ; ^{rosemary.rea@cit.ie} ; Paul Simpson^b ; ^{paul.simpson@teagasc.ie} ; Helena Stack^a ; ^{helena.stack@cit.ie}

关键词：ACE ; Angiotensin Converting Enzyme ; ANOVA ; one-way Analysis of Variance ; ATCC ; American Type Culture Collection ; BHI ; Brain Heart Infusion ; BLAST ; Basic Local Alignment Search Tool ; CITCC ; Cork Institute of Technology Culture Collection ; DPC ; Dairy Products Culture Collection ; KAA ; Kanamycin Aesculin Azide Agar ; KSMEA ; Kanamycin Skim Milk Aesculin Azide Agar ; LAB ; lactic acid bacteria ; OAA ; Oxolinic Acid Aesculin Azide Agar ; RSM ; Reconstituted Skim Milk SMA ; Skim Milk Agar SPSS ; Statistical Pack

刊名：Journal of Microbiological Methods

出版年：2017

8.Molecular modelling, dynamics simulation and characterization of antifungal chitinase from Sechium edule

作者：Bipasha Bhattacharjee^a ; Neeta Pathaw^a ; Nikhil K. Chrungoo^a ; Atanu Bhattacharjee^b ; ^{atanubioinfo@gmail.com}

关键词：CFSSP ; Chou and Fasman Secondary Structure Prediction Server ; BLAST ; Basic Local Alignment Search Tool ; LINC ; Linear Constraint Solver ; PME ; Particle Mesh Ewald

刊名：Gene

出版年：2017

9.Transcription factors regulating uspA genes in Catharanthus roseus

作者：Ahmed Bahieldin^a ; ^b ; ^{bahieldin55@gmail.com} ; Ahmed Atef^a ; ^{ahmed_atefaig2@yahoo.com} ; Ahmed M. Shokry^a ; ^c ; ^{ahmedshokry1@gmail.com} ; Saleh Al-Karim^a ; ^{Skarim@kau.edu.sa} ; Sanaa G. Al Attas^a ; ^{sangtas@mit.edu} ; Nour O. Gadallah^a ; ^d ; ^{nouromar71@yahoo.com} ; Sherif Edris^a ; ^b ; ^e ; ^{sedris@aucegypt.edu} ; Magdy A. Al-Kordy^a ; ^d ; Sabah M. Hassan^a ; ^b ; ^{m_alkordy@yahoo.com} ; Salah Abo-Aba^a ; ^f ; ^{sabmahmoud@yahoo.com} ; Fotouh M. El-Domyati^a ; ^b ; ^{fm_domyati@hotmail.com}

关键词：Transcription factor ; Co-expression ; Erf ; BHLH ; WRKY ; RNA-Seq ; SqRT-PCR

刊名：Comptes Rendus Biologies

出版年：2017

10.Opening the s-triazine ring and biuret hydrolysis during conversion of atrazine by Frankia sp. strain EuI1c

作者：Medhat Rehan^a ; ^c ; ^{medhat.rehan@agr.kfs.edu.eg} ; Gomaah El Fadly^a ; Mona Farid^a ; Aml El sharkawy^a ; Stefan Frä ; nzle^b ; René ; Ullrich^b ; Harald Kellner^b ; Martin Hofrichter^b

关键词：Frankia ; s-triazine ring-cleavage ; Reverse genetics ; qRT PCR

刊名：International Biodeterioration & Biodegradation

出版年：2017

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