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1.Dissecting the Influence of Protein Flexibility on the Location and Thermodynamic Profile of Explicit Water Molecules in Protein–Ligand Binding

作者：Ying Yang ; Markus A. Lill

刊名：Journal of Chemical Theory and Computation

出版年：2016

2.Analysis of Factors Influencing Hydration Site Prediction Based on Molecular Dynamics Simulations

作者：Ying Yang ; Bingjie Hu ; Markus A. Lill

刊名：Journal of Chemical Information and Modeling

出版年：2014

3.Extensive Rigid Analogue Design Maps the Binding Conformation of Potent N-Benzylphenethylamine 5-HT2A Serotonin Receptor Agonist Ligands

作者：Jose I. Juncosa ; Jr. ; Martin Hansen ; Lisa A. Bonner ; Juan Pablo Cueva ; Rebecca Maglathlin ; John D. McCorvy ; Danuta Marona-Lewicka ; Markus A. Lill ; David E. Nichols

刊名：ACS Chemical Neuroscience

出版年：2013

4.Exploring the Potential of Protein-Based Pharmacophore Models in Ligand Pose Prediction and Ranking

作者：Bingjie Hu ; Markus A. Lill

刊名：Journal of Chemical Information and Modeling

出版年：2013

5.Stabilization of an Unusual Salt Bridge in Ubiquitin by the Extra C-Terminal Domain of the Proteasome-Associated Deubiquitinase UCH37 as a Mechanism of Its Exo Specificity

作者：Marie E. Morrow ; Myung-Il Kim ; Judith A. Ronau ; Michael J. Sheedlo ; Rhiannon R. White ; Joseph Chaney ; Lake N. Paul ; Markus A. Lill ; Katerina Artavanis-Tsakonas ; Chittaranjan Das

刊名：Biochemistry

出版年：2013

6.Utilizing Experimental Data for Reducing Ensemble Size in Flexible-Protein Docking

作者：Mengang Xu ; Markus A. Lill

刊名：Journal of Chemical Information and Modeling

出版年：2012

7.Impact of Tributyltin on Immune Response and Life History Traits of Chironomus riparius: Single and Multigeneration Effects and Recovery from Pollution

作者：Thomas M. Lilley ; Lasse Ruokolainen ; Ari Pikkarainen ; Veronika N. Laine ; Janne Kilpimaa ; Markus J. Rantala ; Mikko Nikinmaa

刊名：Environmental Science & Technology (ES&T)

出版年：2012

8.Protein Pharmacophore Selection Using Hydration-Site Analysis

作者：Bingjie Hu ; Markus A. Lill

刊名：Journal of Chemical Information and Modeling

出版年：2012

9.Efficient Incorporation of Protein Flexibility and Dynamics into Molecular Docking Simulations

作者：Markus A. Lill

刊名：Biochemistry

出版年：2011

10.Significant Enhancement of Docking Sensitivity Using Implicit Ligand Sampling

作者：Mengang Xu ; Markus A. Lill

刊名：Journal of Chemical Information and Modeling

出版年：2011

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